文章/答案/技术大牛

发布

社区首页 >问答首页 >关闭R中的read.table连接

问关闭R中的read.table连接
EN

Stack Overflow用户

提问于 2013-05-20 23:41:20

回答 2查看 2.9K关注 0票数 0

我正在运行一个加载多个文件的脚本。当达到50个加载的文件时，我得到一个错误“所有连接都在使用中”。

我认为我必须关闭连接，但我遇到了以下问题。

con = file(paste('/home/rstudio/userstats/',cuserid,'.tsv',sep=""))
userstats_current = read.table(con, sep="\t",  header=0, quote="", stringsAsFactors=F)
close(con)
Error in close.connection(con) : invalid connection

但是，如果我键入以下内容，则一切正常：

con = file(paste('/home/rstudio/userstats/',cuserid,'.tsv',sep=""))
close(con)

当应用read.table时，连接是否会发生变化?我如何设法关闭这些连接？

更新

感谢您的回复。问题是，当我运行foreach循环时，即使在一段时间后，我仍然收到所有连接的错误。

registerDoMC(2)
matrix <- foreach(i=1:nrow(sample), .combine=rbind) %dopar% {....}

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2013-05-21 19:53:40

该错误是由于在文件不存在时运行read.table而导致的。对光盘上不存在的文件进行多次read.table请求时，不会释放连接(与文件确实存在时不同)。

为了克服这个问题，我使用了if (file.exists(文件名)){read.table(文件名)}，这似乎已经解决了这个问题。谢谢你们帮我解决了这个问题。

票数 2

Stack Overflow用户

发布于 2014-01-17 07:53:26

通过url()命令进行http调用时，可能会遇到类似的错误

read.table(url("http://...."),....)

当您尝试连接但收到500 Server错误时，可能会发生这种情况。在这种情况下，read.table可能无法正确关闭连接。在这种类型的多次循环之后，您将累积http CLOSE_WAIT套接字，您可以使用'netstat -a‘查看它，从而导致'all connection in use’错误。

这个问题的解决方案是使用RCurl包来执行URL连接，这在堆栈溢出问题中进行了描述：

堆栈溢出：read data from internet

票数 0

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/16653135

复制

相似问题

问关闭R中的read.table连接
EN

回答 2

Stack Overflow用户

Stack Overflow用户

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐

问关闭R中的read.table连接EN

回答 2

Stack Overflow用户

Stack Overflow用户

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐

问关闭R中的read.table连接
EN