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问使用方法'pmm‘，同时从推算中排除变量
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Stack Overflow用户

提问于 2018-09-17 21:55:49

回答 1查看 161关注 0票数 1

我目前正在使用'pmm‘方法输入R包mice的数据。最小工作示例(给定加载的数据集和正确指定的变量)：

library(mice)
Example_imp <- mice(Example_data, m = 5, maxit = 50, method = "pmm", seed = 500)

我还想从估算中排除一些变量(社会人口统计变量)。它们应该被用作预测值，但它们没有缺失值，这就是为什么对它们没有必要进行推算。我找到了一种指定方法的方法，以便将指定的变量排除在推算之外：

init <- mice(Example_data, maxit = 0) 
meth <- init$method
meth[c("Age", "Nationality", "Gender", "Educ")]=""
Example_imp2 <- mice(Example_data, m = 5, maxit = 50, method = meth, seed = 500)

但是当我输入数据时，我只能指定一次“方法”，也就是说，我指定了method = "pmm"或method = meth。我不能“双重指定”它。那么，我如何使用pmm方法，为什么仍然将一些变量排除在推算之外，而只将它们用作预测值呢？

prediction

r-mice

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2018-09-18 01:27:09

您需要在mice()中设置predictorMatrix值

例如，nhanes数据集：

   age  bmi hyp chl
1   1   NA  NA  NA
2   2 22.7   1 187
3   1   NA   1 187
4   3   NA  NA  NA

所有变量都用于补偿的默认预测矩阵如下所示：

     age hyp chl
age   0   1   1
hyp   1   0   1
chl   1   1   0

例如，如果不需要估算chl，则需要将chl行设置为全0，然后将以下代码设置为您的predictorMatrix

    age hyp chl
age   0   1   1
hyp   1   0   1
chl   0   0   0

票数 1

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/52369448

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