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问将grep存储在变量中，并在bash中执行sed
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Stack Overflow用户

提问于 2022-11-22 07:42:33

回答 2查看 29关注 0票数 2

我有一个包含多个内容的文件，如：

Create initial parsimony tree by phylogenetic likelihood library (PLL)... 0.022 seconds
Perform fast likelihood tree search using LG+I+G model...
Estimate model parameters (epsilon = 5.000)
Perform nearest neighbor interchange...
Estimate model parameters (epsilon = 1.000)
1. Initial log-likelihood: -30833.549
Optimal log-likelihood: -30833.420
Proportion of invariable sites: 0.016
Gamma shape alpha: 2.035
Parameters optimization took 1 rounds (0.226 sec)
Time for fast ML tree search: 2.912 seconds
NOTE: ModelFinder requires 64 MB RAM!
ModelFinder will test up to 546 protein models (sample size: 1544) ...
 No. Model         -LnL         df  AIC          AICc         BIC
  1  LG            31317.712    31  62697.424    62698.736    62863.030
  2  LG+I          31170.012    32  62404.024    62405.422    62574.972
  3  LG+G4         30870.402    32  61804.803    61806.201    61975.751
  4  LG+I+G4       30833.404    33  61732.808    61734.294    61909.098
  5  LG+R2         30881.301    33  61828.602    61830.088    62004.892
  6  LG+R3         30831.187    35  61732.374    61734.045    61919.349
Akaike Information Criterion:           VT+F+R4
Corrected Akaike Information Criterion: VT+F+R4
Bayesian Information Criterion:         VT+F+R4
Best-fit model: VT+F+R4 chosen according to BIC
other content....

我想使用bash命令在部件后面存储元素：

Bayesian Information Criterion:

在一个名为: The_variable的变量中。

到目前为止我试过：

The_variable="$(grep 'Bayesian Information Criterion:' the_file.txt)"

这给了我所有的grep线

echo $The_variable
Bayesian Information Criterion: VT+F+R4

但我希望它只存储VT+F+R4部分。

为了隔离这部分，我尝试了：

sed 's@.*: @@g' $VAR

知道吗？

sed

grep

bash

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-11-22 07:45:46

在awk中比较容易

awk -F ' *: *' '$1 == "Bayesian Information Criterion" {print $2}' file

VT+F+R4

# to save this in a variable:
myvar=$(awk -F ' *: *' '$1 == "Bayesian Information Criterion" {print $2}' file)

此gnu-grep解决方案还将与\K一起工作。

grep -oP 'Bayesian Information Criterion:\h*\K.+' file

VT+F+R4

或者这个sed

sed -n 's/Bayesian Information Criterion: *//p' file

VT+F+R4

票数 4

Stack Overflow用户

发布于 2022-11-22 07:45:39

您可以使用awk打印所需的内容。默认情况下，分隔符是空格，所以在您的情况下，awk '{ print $4 }'将执行这项工作。

➜ echo 'Bayesian Information Criterion: VT+F+R4' | awk '{ print $4 }'
VT+F+R4

票数 1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/74529005

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