问在FDA图-R中绘制凸包
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Stack Overflow用户

提问于 2020-09-01 11:51:38

回答 1查看 137关注 0票数 1

我试图添加一个凸包在这个图中的每一组使用ggpubr包？为什么不起作用？

代码：

library(dplyr)
library(MASS)
library(ggplot2)
library(scales)
library(ggpubr)
library(data.table)

irisfda <- fda(Species ~ ., data = iris, method = mars)
  
df1 <- cbind(data.frame(irisfda$fit$fitted.values), species = iris[,"Species"])

ggplot(df1) +
  geom_point(aes(X1, X2, color = species, shape = species), size = 2.5) + 
  labs(x = "FDA1",y = "FDA1") +  
  stat_chull(aes(color =  species, fill =  species), geom = "polygon", alpha = 0.1)

ggplot2

ggpubr

回答 1

Stack Overflow用户

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发布于 2020-09-01 12:07:36

你还没有告诉stat_chull x和y点在哪里。您告诉geom_point它们在哪里，但是当您将它们添加到一个情节中时，geoms和stats不会相互继承。您可以直接将x和y坐标添加到stat_chull，或者更好地将它们添加到ggplot调用中。然后stat_chull可以继承它们，并且可以保存一些类型。

顺便说一句，您对dplyr、Mass、scales和data.table使用了data.table调用，这在本例中是不需要的，但是您忘记了将库调用放在mda上，这是必需的：

library(ggplot2)
library(ggpubr)
library(mda)

irisfda <- fda(Species ~ ., data = iris, method = mars)
df1 <- cbind(data.frame(irisfda$fit$fitted.values), species = iris[,"Species"])

ggplot(df1, aes(x = X1, y = X2, color = species, shape = species)) +
  geom_point(size = 2.5) + 
  labs(x = "FDA1",y = "FDA1") +  
  stat_chull(geom = "polygon", alpha = 0.1)

票数 1

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/63687115

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