当我们使用具有各向同性平滑器的mgcv包绘制GAM模型时,我们有一个轮廓图,如下所示:
假设在这个模型中,我们有许多其他各向同性平滑器,如:
y ~ s(x1, x2) + s(x3, x4) + s(x5, x6)我的怀疑是:当解释s(x1, x2)的等高线图时,其他各向同性平滑者会发生什么?他们是“固定在他们的中间”吗?我们能单独解释一个s(x1, x2)图吗?
发布于 2020-04-27 17:32:10
由于该模型在函数中是可加性的,所以可以分别解释函数(单独的s()术语),但不一定是协变量对响应的单独影响。在您的情况下,在每个二元平滑的协变量之间没有重叠,所以您也可以将它们解释为协变量对响应的影响,而不是其他平滑的。
所有光滑函数通常都受从和到零的约束,以允许模型常量项(截距)成为可识别的参数。因此,每幅图中的0行是模型常量项(按链接函数或线性预测器的比例)的值。
plot.gam(model)输出中显示的图是部分效果图或部分图。如果您对理解该术语对响应的影响感兴趣,您基本上可以忽略其他术语,这是该术语的协变量的函数。
如果模型中有其他术语,其中可能包含另一个或多个协变量,并且您希望查看响应随该术语或队列的变化而发生的变化,那么您应该从模型中预测您感兴趣的变量的范围,同时将其他变量保存在一些表示值上,比如它们的均值或中间值。
例如,如果你有
model <- gam(y ~ s(x, z) + s(x, v), data = foo, method = 'REML')而且您想知道响应是如何变化的,仅作为x的函数,您可以将z和v修正为有代表性的值,然后对x的范围进行预测。
newdf <- with(foo, expand.grid(x = seq(min(x), max(x), length = 100),
z = median(z)
v = median(v)))
newdf <- cbind(newdf, fit = predict(model, newdata = newdf, type = 'response'))
plot(fit ~ x, data = newdf, type = 'l')此外,请参阅mgcv包中的?vis.gam,作为准备类似于此的情节的一种方法,但它可以在其中完成艰苦的工作。
https://stackoverflow.com/questions/61450053
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