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问使用renv时，Rscript无法识别库
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Stack Overflow用户

提问于 2020-04-14 05:01:49

回答 2查看 460关注 0票数 1

我在Mac上工作，使用的是R的3.6.3版本，使用的是renv。在Rstudio和R中，我可以加载我安装的软件包的库，例如library(ggplot2) works。但是，当我使用Rscript运行脚本时，我收到以下消息

Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’

根据这个所以answer，我需要确保

Sys.getenv('R_LIBS_USER') in R.exe

的值与

Rscript.exe -e ".libPaths()"

但是值是相同的，两者都指向我的项目文件夹中的renv-system-library。

那么我该如何解决这个问题呢？

renv

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2020-04-15 06:13:24

我设法解决了这个问题。akruns的答案是有用的，它不工作，但给我指明了错误的方向。答案不起作用，因为使用它时，我收到以下错误：

    Error: package or namespace load failed for ‘ggplot2’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'pillar', details:
  call: utils::packageVersion("vctrs")
  error: there is no package called ‘vctrs’

现在vctrs在'/path/where/library/is/located'中，所以我认为依赖包不是从该路径加载的，而是Rscript的默认路径。在脚本中放入一个print(.libPaths()会给出

"/usr/local/Cellar/r/3.6.3_1/lib/R/library"

而不是

[1] "/Users/Chris/Sites/app_name/renv/library/R-3.6/x86_64-apple-darwin18.7.0"
[2] "/private/var/folders/5_/p_yl0439059b7_jdqzrm0hr40000gr/T/RtmptdHcWN/renv-system-library"

用于Rstudio中的.libPaths()。查看实际运行Rscript程序的ruby程序，我发现它是使用--vanilla选项运行的，即

Rscript --vanilla script_name

删除--vanilla选项解决了这个问题。我认为带有--vanilla选项的脚本停止工作是因为我使用brew重新安装了R，以解决我遇到的另一个问题，并在其中发出了以下命令：

brew link --overwrite r

票数 0

Stack Overflow用户

发布于 2020-04-14 05:06:41

在library调用中指定lib.loc可能更好

library(ggplot2, lib.loc = '/path/where/library/is/located')

票数 2

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/61196694

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