问你好，我想用我的数据集在R中创建tsne图。但是当我写命令的时候，我得到了这个错误
EN

Stack Overflow用户

提问于 2020-04-06 18:48:50

回答 1查看 56关注 0票数 0

library(Rtsne)

setwd("n/g")

expression_data <- read.table(file = "zdata.matrix.xlsx", row.names = 1, sep=',', header = T)
meta_data <- read.table(file = "atac_v1_pbmc_10k_singlecell.xlsx", row.names = 1, sep=',', header = T)

tsne_realData <- Rtsne(expression_data, perplexity=10, check_duplicates = FALSE)

# Error in terms.formula(object, data = data) : 
#  '.' in formula and no 'data' argument

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2020-04-07 20:31:16

我简要介绍了Rtsne package documentation，Rtsne()函数要求数据格式为矩阵。在将expression_data传递给Rtsne函数之前，尝试将其转换为矩阵。您可以这样做：

library(Rtsne)

setwd("n/g")

expression_data <- read.table(file = "zdata.matrix.xlsx", row.names = 1, sep=',', header = T)
meta_data <- read.table(file = "atac_v1_pbmc_10k_singlecell.xlsx", row.names = 1, sep=',', header = T)
expression_matrix <- as.matrix(expression_data)

tsne_realData <- Rtsne(expression_matrix, perplexity=10, check_duplicates = FALSE)

票数 0

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/61058056

复制

相似问题

问你好，我想用我的数据集在R中创建tsne图。但是当我写命令的时候，我得到了这个错误
EN

回答 1

Stack Overflow用户

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐

问你好，我想用我的数据集在R中创建tsne图。但是当我写命令的时候，我得到了这个错误EN

回答 1

Stack Overflow用户

社区

活动

圈层

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐

问你好，我想用我的数据集在R中创建tsne图。但是当我写命令的时候，我得到了这个错误
EN