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  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    一个抗体两个靶标,联合T细胞治疗B细胞恶性肿瘤

    双特异性抗体是指可以同时结合两种抗原的抗体,与普通抗体相比,双特异性抗体增加了一个特异性抗原结合位点,因而可能在机体中产生新的、普通抗体无法介导的生物学机制, 例如,今天要介绍的桥接机制 RG7828 (mosunetuzumab) 它是一种人源化靶向B细胞上的CD20和T细胞上的CD3双特异性抗体 (bispecific T cell engager)。 目前,该药处于II期临床开发,主要用于治疗血液系统中B细胞来源的恶性肿瘤。 罗氏在2019年美国血液学年会上发表了该药的一些临床数据: 在预后极差的复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤(R/R B-NHL)患者中,惰性NHL患者和侵袭性NHL患者总缓解率(ORR)分别为62.7% 不良反应方面,有28.9%的患者出现细胞因子释放综合征(CRS),其中20.0%为1级、1.1%为3级,3级神经系统不良事件发生在3.7%的患者中。

    28310编辑于 2023-02-28
  • 来自专栏抗体蛋白

    B细胞筛选加速羊驼VHH发现:Hypercell高通量微流控系统在纳米抗体研发中的应用

    本文结合真实药企案例,对Hypercell高通量单细胞分选系统在羊驼VHH纳米抗体发现中的应用流程进行整理,包括羊驼PBMC处理、B细胞激活、单细胞液滴包裹、高通量功能分选、NGS测序以及AbFinder 关键词:单B细胞筛选、单细胞筛选、单B细胞分选、B细胞抗体发现B细胞抗体筛选、羊驼纳米抗体、单B细胞分选、纳米抗体筛选、VHH抗体发现抗体药物研发、涛烜Hypercell、纳米抗体快速筛选为什么纳米抗体发现越来越关注单 随着单细胞技术与微流控液滴技术的发展,越来越多研究机构开始尝试基于单B细胞水平直接开展抗体发现工作。 、ADC、CAR以及创新诊断试剂研发的药企与科研机构而言,基于单B细胞的高通量筛选方案,能够帮助缩短研发周期并提高抗体发现效率。 更多关于Hypercell高通量单细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现以及单细胞抗体筛选也可参考曼博生物相关技术资料关于技术来源本文基于Hypercell单B细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现方案、单细胞抗体筛选系统

    11210编辑于 2026-05-19
  • 来自专栏DrugOne

    用于药物发现抗体表征学习

    作者开发了一个抗体序列特定的预训练语言模型。发现在通用蛋白质序列数据集上对模型进行预训练可以更好的支持特征细化和学习抗体结合预测。 CDR的氨基酸序列决定了抗体将结合的抗原。抗体设计主要就是设计其CDR区。在针对特定靶标设计优化的候选抗体时,会考虑抗体的许多天然特性,包括结合亲和力、结合特异性、稳定性、溶解度和效应器功能。 抗体结合亲和力是本文重点讨论的特性。 抗体数据集 为了评估和比较学习的表示和传统的抗体特征,作者为抗体结合预测任务准备了以下几个基准数据集。 总结 作者发现预训练中使用最多样化和通用的数据集 (Pfam) 时,亲和力性能最好。该结果支持抗体结构和功能特性不仅仅由抗体序列决定的假设。很可能还依赖于在一般蛋白质序列中更广泛遇到的其他特征。 其次,作者发现大小在 3200 到 6400 个样本之间的训练集在亲和力绑定任务中提供了最高的性能增益。 参考资料 https://arxiv.org/abs/2210.02881

    86150编辑于 2022-11-28
  • 来自专栏生命科学

    抗体偶联药物 (ADC)——抗肿瘤细胞 | MedChemExpress

    ADC 由抗体 (Antibody)、细胞毒素分子 (ADC Cytotoxin, payload) 以及连接两者的连接子 (Linker) 组成。 一个成功的 ADC 分子,首先要保留单克隆抗体的选择性,同时能够释放足够高浓度的 payload,从而达到杀死肿瘤细胞的目的。我们先看下 ADC 发挥作用的步骤和机制。 疏水性预测:在新 ADC 的发现和开发阶段,为了降低 ADC 的疏水性,尽可能降低有效毒素分子和连接子的分子量是至关重要的。 非特异性内吞作用:一般来说,IgG 抗体的净正电荷增加导致血浆清除率增加,组织分布增加。因此,优化 ADC 表面电荷,减少正常细胞中非靶向摄取,同时保留靶点肿瘤细胞摄取,有利于改善治疗指标 (TI)。 SMCC 接合抗原耦合脾脏细胞来诱导抗原特异性免疫反应。 SMCC-DM1 是由微管破坏剂 DM1 和 ADC linker SMCC 连接而成,可用来制备抗体偶联药物。

    96650编辑于 2023-03-08
  • 第20篇HD文章(正刊)--癌症中异位表达的NMDAR揭示了种系编码的自身免疫性

    进一步对TNBC切片进行空间RNA(visium HD)分析发现,GRIN2B转录本仅存在于癌细胞cluster中,且癌细胞也表达NMDAR支架蛋白GKAP。 通过建立多西环素诱导表达GluN1-GluN2B的4T1小鼠三阴性乳腺癌模型,发现细胞中异位表达的NMDAR亚基(GRIN1和GRIN2B)具有高度免疫原性。 此外,对肿瘤引流淋巴结来源B细胞的分析发现,具有NMDAR结合能力的细胞主要是未突变的幼稚B细胞,且从中筛选出两种未突变抗体同样具有NMDAR结合能力。 通过与已报道的患者来源抗体结构比较,发现多个抗体表位存在明显收敛:OX1与003-102抗体均与GluN1 Arg260形成极性相互作用;SK5B成熟抗体在GluN1 ATD R1叶的表位与008-218 这些发现揭示了肿瘤来源抗体在克隆型内部和克隆型之间表位的多样性,并证明了跨物种的表位收敛于GluN1-GluN2B ATD区域。

    10720编辑于 2026-03-30
  • . | 用 AlphaFold-Multimer 发现 GPCR 纳米抗体

    然而,传统抗体发现流程面临系统性瓶颈: 方法 原理 主要局限 免疫动物 体内 B 细胞免疫筛选 哺乳动物靶点高度保守 → 免疫耐受失败;周期 6–18 个月 噬菌体展示 体外文库筛选 需专业设备;常产生多反应性 根本原因在于 GPCR 构象动态性强、重组蛋白产量低,难以满足传统抗体发现流程所需的高质量样本要求。 AF-M 对抗体-抗原复合物的预测完全依赖 PDB 结构模板。这一限制长期以来被视为 AF-M 用于抗体发现的根本性障碍。 coli BL21(DE3)(pET26B 载体,C端 V5+6×His 标签) • 纯化:蛋白A亲和 + Ni-NTA 亲和双步纯化 • 浓缩至 >100 μM(~1.6 mg/mL) 5.2 细胞结合实验 • GPCR 抗体治疗空白:目前 GPCR 抗体在 FDA 批准药物中严重欠代表(<1%),本方法体系有望系统性加速 GPCR 靶向抗体药物的早期发现阶段。

    19410编辑于 2026-05-08
  • 来自专栏生信技能树

    B细胞可分泌GABA需要单细胞数据证明

    看到了朋友圈转发一个最新的(November 2021)发表在nature杂志的研究成果,日本RIKEN的科研团队首次发现B细胞竟会分泌一种神经递质——γ-氨基丁酸(GABA),进而抑制细胞毒性T细胞功能 除去B细胞之后,小鼠体内的抗肿瘤免疫也变强了。这个研究也是有转录组测序数据的,在GSE169543 and GSE183246.。 GABARAPL1","GABARAPL2","NSF","TRAK2","PLCL1","GPHN","SLC12A5","GABRR1","GABRR2","GABRR3","CACNA1A","CACNA1B" 可以看到B细胞并没有特殊之处哦: 当然了,需要跟降维聚类分群结果对应,如下所示: 从全局表达量来说,B细胞其实是非常特殊了,可惜,它的 GABA相关基因 并没有特殊之处 在AML疾病单细胞数据集查询该基因列表 b细胞各个亚群都或多或少表达GABA相关基因 可以看到, b细胞各个亚群都或多或少表达GABA相关基因,那么这样的结论值得发表在 nature杂志 吗?

    58440发布于 2021-11-23
  • 来自专栏智药邦

    细胞数字孪生加速药物发现

    而在药物发现过程中,DeepLife也做出了尝试。 DeepLife的细胞数字孪生 很大程度上,药物发现仍然是一个孤立的迭代过程,其中数据由不同的湿实验室生物学家、生物信息学家和工程师团队解释、访问和分析。 构建组学数据和发现平台 两年前,DeepLife着手开发其数字孪生技术(图1),首先是构建组学数据和发现平台。 DeepLife正在将这一概念应用于药物发现细胞是独特的复杂对象,但组学数据的激增使得生成不健康细胞的全面图像成为可能。DeepLife使用组学数据在计算机中创建细胞的数字孪生。 将单细胞分析从体外转移到计算机中对药物发现具有深远的影响。

    1.2K20编辑于 2022-06-08
  • 来自专栏DrugOne

    Science | 解码免疫的语言

    浆母细胞和浆细胞(统称为抗体分泌细胞,ASCs)是在B细胞激活和分化后形成的,这一过程涉及对转录机制的完全重编程以及内质网和高尔基体的重塑。 Giguère等人发现,与其他基因相比,人类和小鼠ASCs中的抗体mRNA序列显示出对肌苷-34修饰的tRNA所识别的密码子有保守的偏好,并且ASCs中富含带有肌苷修饰的tRNA。 尽管已经发现ADAR介导的肌苷修饰的增加,但tRNA库可用性的变化及其对细胞翻译动态的影响仍然未明。 Giguère等人揭示了密码子使用在选择B细胞进入记忆库方面的作用。激活后,B细胞经历基于亲和力的选择,以扩展具有最强抗原结合变异区的罕见克隆。 通过检查人类接种疫苗后的抗体库,Giguère等人发现相对于原始B细胞库,浆细胞和记忆B细胞中编码抗原结合域(可变区域)的mRNA中富含依赖I34的密码子。

    38310编辑于 2024-01-30
  • 来自专栏智药邦

    机器学习+抗体发现和设计|BigHat与杨森制药达成战略合作

    2024年4月24日,拥有人工智能/机器学习引导抗体发现和开发平台的生物技术公司BigHat Biosciences宣布与强生旗下杨森制药达成合作。 这一战略合作将强生的药物发现、临床开发和数据科学专业知识与BigHat的Milliner™平台相结合,后者是一套与高速湿实验室集成的机器学习技术,用于指导多个神经科学治疗靶点的高质量抗体的设计和选择。 BigHat的抗体设计平台Milliner™将基于合成生物学的高速湿实验室与最先进的机器学习技术整合成一个全栈式抗体发现和工程平台,从而设计出具有更复杂功能和更好生物物理特性的抗体。 这种方法降低了设计抗体和其他治疗蛋白的难度,以应对从慢性病到危及生命的疾病,同时还大大加快了候选药物的发现和验证。 BigHat是一家B轮融资的生物技术公司,位于旧金山郊外。我们的独资和合作治疗项目主要集中在癌症和炎症等需求尚未得到满足的适应症领域。

    41810编辑于 2024-05-08
  • 来自专栏量子位

    杨晓明团队发现单抗有效,临床申报正在推进,研究已登Nature子刊

    面对来势汹汹的德尔塔变异株,人类这边有了最新科研成果: 国药集团宣布,发现的新单克隆抗体,对德尔塔变异株有效! 反应抗体有效性的指标中和活性IC₅₀可达5ng/ml。 具体做法是,把能分泌特定抗体的免疫细胞与一种无限繁殖的骨髓瘤细胞做杂交。 产生的杂交瘤细胞继承了双亲细胞的能力,一旦制备成功就可以不断产生完全一致的单克隆抗体了。 抗体2B11对德尔塔病毒有效 那么针对这次的德尔塔变异种,中国军团在单克隆抗体方面到底有怎样的新发现? 核心依靠的技术,是噬菌体展示技术。 噬菌体是入侵细菌的病毒。 研究人员发现抗体2B11对原始、以及三种病毒变异株有很强的中和能力。 ? 其中面对原始病毒,抗体2B11中和活性IC50达5ng/ml。 而且,2B11所识别的RBD表位与ACE2的结合位点高度重叠,可有效阻断新冠病毒与细胞表面的ACE-2结合,进而阻止其感染细胞。 ?

    48950发布于 2021-08-10
  • 来自专栏流式抗体推文

    科研人必备:Elabscience FITC 标记抗人 CD45RO 抗体,您流式实验的可靠伙伴

    Elabscience FITC 标记抗人 CD45RO 抗体[UCHL1]高特异性、高灵敏度的FITC标记抗人CD45RO单克隆抗体,适用于流式细胞术,可有效区分原始T细胞与记忆T细胞,为免疫学研究提供可靠工具 它是酪氨酸磷酸酶CD45的剪接变体,缺乏a、B和C决定因子。CD45RO亚型在活化T细胞和记忆T细胞、某些B细胞亚群、活化单核/巨噬细胞和粒细胞上表达。 CD45RO增强T细胞受体和B细胞受体信号介导的激活。CD45及其同工型在T淋巴细胞B淋巴细胞上与淋巴细胞磷酸酶相关磷酸蛋白(LPAP)非共价结合。 当抗体细胞表面的CD45RO抗原结合后,通过流式细胞仪检测荧光信号强度,即可定量分析CD45RO阳性细胞的比例及表达水平。 无论您是研究基础免疫机制,还是探索疾病发病机理,这款抗体都能为您提供准确、可靠的结果,助力您的科研发现

    27210编辑于 2025-11-10
  • 来自专栏流式抗体推文

    Elabscience PE Anti-Mouse CD3 抗体 :流式细胞术的 T 细胞靶向专家

    产品介绍PE抗小鼠CD3抗体[17A2]是专为小鼠 T 细胞研究设计的实验试剂,核心信息如下:基础属性:由大鼠宿主产生,亚型为 Rat IgG2b, κ,克隆号 17A2,仅与小鼠样本发生特异性反应,无交叉反应干扰 检测原理PE抗小鼠CD3抗体[17A2]基于荧光流式细胞术(FCM) 原理发挥作用:特异性结合:抗体的抗原结合区可与小鼠细胞表面的 CD3 分子特异性结合,确保靶向识别的准确性。 实验中以 PE Rat IgG2b, κ 同型对照 [LTF-2] 排除非特异性结合干扰,保证结果可靠。 应用领域该抗体专为荧光流式细胞术(FCM)优化,广泛应用于以下研究场景:T 细胞活化与增殖机制研究:通过检测 CD3 分子表达变化,解析 T 细胞活化信号通路。 Elabscience 专注于生命科学研究服务,为科研探索提供优质试剂支持,如需开展 T 细胞相关研究,这款抗体无疑是理想之选。

    32310编辑于 2025-09-18
  • 来自专栏科研菌

    自己做了单细胞测序现在发6分还得补这么多实验?

    而当使用增强ADCC的抗体时,一些表达CTLA-4的效应T细胞是否被抗CTLA-4抗体减少尚不清楚。作者发现,pH敏感的抗CTLA-4抗体在ADCC和肿瘤排斥中更有效。 虽然大部分Foxp3-CD4 T细胞表面CTLA-4呈阴性,但仍可识别到表达CTLA-4的细胞,因而成为抗CTLA-4抗体的潜在靶点(图1b)。 于是作者根据CD8 T细胞、巨噬细胞M1、静息CD4记忆T细胞的含量对22种癌症类型进行排序(图5b)。加权排序见表1。 CTLA-4抗体处理荷瘤小鼠,分析发现新一代抗体选择性减少高表达CTLA-4的细胞。 于是作者进一步通过分析人类NSCLC浸润T细胞的流式细胞术和单细胞RNAseq分析结果,发现增强ADCC的抗CTLA-4抗体对活化的Treg具有高度选择性。

    88220发布于 2020-08-24
  • 来自专栏DrugOne

    AntiBERTy-抗体预训练模型

    最初的抗体由浆细胞(分化B细胞)分泌,这种细胞通过VDJ基因重组的方式将抗体(BCR: B细胞受体蛋白)序列每个结构域的三片段组装起来,从而构建出千变万化的序列。 通过体内淋巴循环系统的流动,在淋巴结的B细胞滤泡中,庞大的B细胞受体库先接受抗原对其进行的达尔文式的选择,从无比庞大的B细胞群中选出其受体能与抗原有足够亲和性的B细胞(此时初代抗体的结合力还比较弱)。 随着免疫反应的进程发生,这类B细胞抗体结合相关的基因片段的不断发生点突变(相当于进一步构建子库),那些亲和力更强的抗体序列得到进一步地富集,这个过程称之为亲和成熟。 的捐献者免疫组库进行分析,将所有的序列进行矢量化,并制作k-nearest-neighbor graph,作图可以看见,4位病人的的抗体亲和力进化的轨迹,有趣的是将4组抗体序列进化路线整合在一起时,可以发现随着病程的进展 ,其中有3位都进化出了类似的VRC01组抗体序列,通过统计冗余度,作者发现embedding空间的序列分布较为均一,这一现象可能与抗体的多轮迭代的亲和成熟有关,从而产生了足够的抗体多样性。

    1.1K20编辑于 2021-12-29
  • 来自专栏智药邦

    Nature npj|机器学习在疫苗靶标选择中的开发和应用

    图1 合理设计疫苗流程示意图(a); 机器学习在疫苗靶标选择的任务中的应用:B和T细胞表位的发现[B细胞表位发现,抗原呈递的预测]和免疫原设计[抗原免疫原预测](b、d);通过epitope-paratope B细胞表位识别 基于只有少数序列和结构属性可以确定某个残基是否可以为抗体结合位点的假设,很多B细胞表位发现的方法,主要应用基于特征的机器学习方法。 抗原免疫原性预测 免疫原性预测方法的最大AUROC为0.7,低于B细胞表位预测。主要缺点对机器学习模型中的特征的科学共识不清楚,比如与HLA的高亲和力和稳定性是否与高免疫相关,不太清楚。 epitope-paratope相互作用 机器学习方法主要有下面两种: (i) 仅使用TCR/抗体的结构的信息;(ii) TCR/抗体-抗原结合对的信息。 图2 用于预测B细胞和T细胞表位-抗体相互作用的ML方法方案,仅使用TCR/抗体信息(a、b) vs TCR/抗体-抗原对;序列(a,c) vs 基于结构(b、d)。

    61011编辑于 2024-06-12
  • 【免疫学笔记】血球凝集和血型分型

    凝集反应是通过与A 或B 血型物质结合的抗体或凝集素(称为抗A 或抗B)诱导的(图1)。多拷贝的血型抗原排列在红细胞表面,使红细胞抗体交叉连接时发生凝集反应。 因此,O型个体虽缺乏A和B抗原,但可以具有抗A和抗B抗体,而AB型个体则没有抗A和抗B抗体。含有抗A和抗B抗体的输血供体或接受者的红细胞凝集模式揭示了个体的ABO血型。 间接库姆斯试验检测母体血清中非凝集的抗Rh 抗体,其步骤是:首先将血清与Rh+ 红细胞共孵育,其中Rh+ 红细胞结合抗Rh 抗体,洗涤抗体包被的细胞除去未结合的免疫球蛋白,然后凝集抗免疫球蛋白抗体(图2 在下一胎妊娠中,这些抗体会进入胎儿体内,结合在胎儿红细胞表面,导致胎儿红细胞破坏(溶血),引发严重的新生儿溶血病。 ABO抗体(抗A/抗B):通常属于 IgM类 抗体。 Rh溶血的严重性在于IgG抗体能过胎盘,以及Coombs试验在诊断(直接试验)和产前筛查(间接试验)中的关键作用。通过这种检测,医生可以及时发现并干预,保护胎儿健康。

    29710编辑于 2025-12-29
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    细胞免疫组库的应用

    T细胞B细胞是适应性免疫应答的重要成分。 B细胞合成和分泌的抗体,可特异性识别病原微生物的抗原分子,中和病原微生物的传染性,并通过各种效应机制来清除携带抗原分子的病原微生物,执行体液免疫的功能。 且B细胞在受到抗原刺激后,可能发生体细胞高频突变(Somatic hypenmutation,SHM),使得B细胞表达抗体分子具有显著的多样性。 基于TCR数据分析,发现肝癌内存在大量肿瘤组织特异的克隆增生的T细胞,但是这些细胞大多处于耗竭状态,从而揭示了肿瘤细胞逃逸免疫监视的原因。 此外,该研究还描绘了初始T细胞向耗竭状态的发展轨迹,并在耗竭性CD8 T细胞亚群中发现了一类FOXP3+抑制性T细胞的存在,提出了耗竭T细胞会进一步发展成抑制性T细胞的潜在发展方向。

    1.5K10发布于 2020-08-06
  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    想申报新型冠状病毒(2019-nCoV)专项项目,下面这些国自然摘要可能是你需要的

    在前期研究中,我们发现过表达MARCH1和8蛋白能够有效地抑制SARS和MERS病毒S蛋白在细胞中的表达,降低S蛋白包装入慢病毒颗粒,进而抑制S蛋白介导的慢病毒转导。 本项目拟基于前期研究,改良EB病毒转化人外周血记忆性B细胞技术;研发识别MERS-CoV S2应急救治抗体;阐明不同呼吸道冠状病毒感染后抗体的交叉反应性;填补国内外空白并协助疫情防控 冠状病毒-4* 冠状病毒和流感病毒等新发 核定位信号去除的ORF4b不能抑制IRF3/7激活的干扰素产生,提示ORF4b细胞核内也存在着未知拮抗干扰素产生的分子机制。 本课题拟在前期结果基础上,构建ORF4b缺失的感染性克隆,并进行两方面研究:首先明确ORF4b细胞质中拮抗干扰素产生的具体机制,其次重点研究ORF4b细胞核中抑制IRF3激活的干扰素产生的分子机制, 研究还发现,包括SARS-CoV在内的多种CoV具有抗体依赖性感染增强现象(ADE)。

    37020编辑于 2023-02-28
  • 来自专栏智药邦

    AI+抗体设计|BigHat完成7500万美元B轮融资

    2022年7月20日,利用机器学习和合成生物学为患者开发更安全、更有效的抗体疗法的生物技术公司BigHat Biosciences宣布已筹集了7500万美元的B轮融资。 这些资金将用于扩大Milliner的能力 (一个集成的人工智能/ML-湿实验室平台),推动治疗项目走向人体临床试验,积极招聘药物发现和开发人才,并加速与顶尖合作伙伴的战略合作。 人工智能抗体设计平台Milliner提供了快速、可靠地创造突破性疗法的基本技术。 在BigHat,每个治疗项目都从设计规划和在BigHat的发现引擎中生成的抗体开始,或者由合作伙伴提供。 2022年3月,BigHat收购了Frugi Biotechnology,将定制的无细胞蛋白质合成(CFPS)技术整合到其平台中。此外,还纳入了哺乳动物细胞系能力和功能检测。 https://www.businesswire.com/news/home/20220720005177/en/BigHat-Biosciences-Raises-75-Million-in-Series-B-Funding-to-Design-Safer-More-Effective-Antibodies

    56420编辑于 2022-11-16
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