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流式分选后指定细胞亚群的表达量差异(无需单细胞)
其实没有单细胞也是可以研究具体的细胞亚群的表达量差异，那就是流式分选指定细胞亚群，比如： Hepatic CD4+ or CD8+ T-cells of 12 months NASH-diet + 8 digestion and percoll gradient enrichment and subsequently single-cell sorted (sorted gate: L/D-,CD11b- + 8 weeks treatment (IgG, α-PD-1 or α-CD8) strain: C57BL/6 organ: Liver selection marker: L/D-,CD11b- 更多类似的先分选指定细胞亚群再进行差异表达量分析的研究 比如数据集：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi? 所以这个研究其实是还辅助了 assay for transposase-accessible chromatin by sequencing (ATAC-Seq) ，这个技术我们也录制了对应的视频，课程观看方式 视频免费在B站
86410发布于 2021-03-24 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 支持 1 Assay 处理 1×10⁷个原始细胞，分离后细胞纯度可达 95.2%（分选前纯度仅 6.0%），能满足科研对高纯度细胞的需求。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 分选过程中，试剂盒中的特异性抗体与非目标细胞结合，再通过磁珠分离等步骤去除杂细胞，最终保留高纯度、高活性的目标细胞，确保下游实验的稳定性和重复性。
17610编辑于 2025-11-13 - 来自专栏抗体蛋白
单B细胞筛选加速羊驼VHH发现：Hypercell高通量微流控系统在纳米抗体研发中的应用
关键词：单B细胞筛选、单细胞筛选、单B细胞分选、B细胞抗体发现、B细胞抗体筛选、羊驼纳米抗体、单B细胞分选、纳米抗体筛选、VHH抗体发现、抗体药物研发、涛烜Hypercell、纳米抗体快速筛选为什么纳米抗体发现越来越关注单 随着单细胞技术与微流控液滴技术的发展，越来越多研究机构开始尝试基于单B细胞水平直接开展抗体发现工作。 Hypercell系统：单日分选+一周获得VHH序列涛烜科学推出的Hypercell高通量单细胞分选系统，构建了从羊驼PBMC、B细胞激活、单细胞分选、建库测序到序列分析的完整工作流，可实现单日完成高通量单细胞功能分选 羊驼单B抗体发现流程图核心实验数据：高检出率与高阳性率本次实验中，Hypercell系统共获得：分选总Hit数：2557个拼接有效序列：1631条初步验证序列：29条其中：单阳性序列数：25条（86%） 更多关于Hypercell高通量单细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现以及单细胞抗体筛选也可参考曼博生物相关技术资料关于技术来源本文基于Hypercell单B细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现方案、单细胞抗体筛选系统
11010编辑于 2026-05-19 - 来自专栏技术文章
告别分选困扰，Elabscience 让记忆 T 细胞分离快人一步～
它们通过分泌特定的细胞因子来激活和指导其他免疫细胞（如B细胞和CD8+ T细胞），是形成有效、持久免疫应答的关键。记忆CD4+ T细胞对维持长期免疫记忆至关重要。 为此，Elabscience®全新推出的人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，通过去除非目的细胞，从而富集未被标记的目标细胞，分选后可得到一种最接近天然状态、功能完整 产品速览Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出Memory CD4/CD8 T细胞。 它可以保持目的细胞未受刺激的原始状态，得到的细胞不带有任何抗体和磁珠标记，可直接进行下游应用。产品优势无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于85%。 结果展示以上就是Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒的相关介绍，更多细胞分选试剂盒持续上线中。
9700编辑于 2025-12-31 - 来自专栏生信技能树
B细胞可分泌GABA需要单细胞数据证明
看到了朋友圈转发一个最新的（November 2021）发表在nature杂志的研究成果，日本RIKEN的科研团队首次发现，B细胞竟会分泌一种神经递质——γ-氨基丁酸（GABA），进而抑制细胞毒性T细胞功能 除去B细胞之后，小鼠体内的抗肿瘤免疫也变强了。这个研究也是有转录组测序数据的，在GSE169543 and GSE183246.。 GABARAPL1","GABARAPL2","NSF","TRAK2","PLCL1","GPHN","SLC12A5","GABRR1","GABRR2","GABRR3","CACNA1A","CACNA1B" 可以看到B细胞并没有特殊之处哦： 当然了，需要跟降维聚类分群结果对应，如下所示： 从全局表达量来说，B细胞其实是非常特殊了，可惜，它的 GABA相关基因 并没有特殊之处 在AML疾病单细胞数据集查询该基因列表 b细胞各个亚群都或多或少表达GABA相关基因 可以看到， b细胞各个亚群都或多或少表达GABA相关基因，那么这样的结论值得发表在 nature杂志 吗？
58340发布于 2021-11-23 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 阴性分选技术！人初始 CD4⁺T 细胞分离一步到位，省时高效
内容概要Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒专为分离人初始 CD4⁺T 细胞设计，适配新鲜或冻存的人 PBMC 样本。 凭借高效阴性分选技术，可实现 96% 以上的高纯度分选，1 次实验能处理 1×10⁷个细胞，且细胞可直接用于下游研究，为免疫相关研究提供可靠工具支持。 传统分选方法存在操作复杂、分选纯度低、细胞活性受损等问题，难以满足高精度科研需求。而精准分离高纯度初始 CD4⁺T 细胞，是开展相关基础研究与临床转化研究的前提，市场对高效、可靠的分选工具需求迫切。 检测原理Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD4⁺T 细胞以外的杂质细胞（如 CD8⁺T 细胞、B 细胞、单核细胞等），实现初始 CD4⁺ 药物研发：评估候选药物对初始 CD4⁺T 细胞功能的影响，筛选免疫调节类药物。产品优势高纯度分选：分选后细胞纯度可达 96% 以上，显著优于传统方法，减少杂质细胞干扰。
16410编辑于 2025-11-14 0单细胞单样本读取方法
通常h5ad文件由Python的单细胞分析工具Scanpy生成，使用一个GitHub包，名字是seurat-disk，首先一个Convert函数，然后一个LoadH5Seurat即可展开代码语言：TXTAI
18610编辑于 2026-01-14- 来自专栏用户7627119的专栏
R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件
前面我们简单的介绍过免疫组库以及单细胞免疫组库的应用。今天给大家介绍一个做免疫组库数据分析很实用的数据库IMGT，以及如何使用R从IMGT批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件。 一、IMGT简介 IMGT （http://www.imgt.org/）是免疫遗传学（ImMunoGeneTics）的缩写，专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors 也很容易，前面我们讲过通过剪贴板在R和Excel之间移动数据，那么我们可以先把这个网页上的内容贴到Excel表中，选取B列，copy，然后在通过scan函数读到R中备用。 B细胞受体VDJ序列文件的下载链接如下，留给大家自己练习吧！
95150编辑于 2022-09-21 - 来自专栏技术文章
Elabscience 高纯度初始 T 细胞分选试剂盒来破局
随着分选技术的不断精进和对T细胞亚群认知的深化，未来将能设计出更具战斗力、作用更持久的活细胞药物，造福更多患者。 Elabscience®全新推出的人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，无需直接标记人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞，避免抗体结合导致的细胞激活或表位遮蔽 产品内容Elabscience®人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞 无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于95%。无需分离柱进行分离。实验耗时短，最快15分钟可完成阴性细胞分选。可用于新鲜人PBMC样本或冻存PBMC样本。 ，分选前后人初始Pan T细胞CD3+CD45RA+CD45RO-CD197+的细胞纯度分别为6.0%和95.2%。
49810编辑于 2025-11-03 - 来自专栏生信技能树
B细胞亚群中存在Breg亚群（regulatory B cells，Breg）吗？
, 初始B细胞是未接触过抗原的B细胞，它们在骨髓中成熟后迁移到外周淋巴组织，等待抗原刺激。 and AICDA，生发中心B细胞是B细胞在免疫反应中发生体细胞高频突变和类别转换重组的场所，它们在生发中心中与T细胞和树突状细胞相互作用，进一步分化为浆细胞或记忆B细胞。 ，参与B细胞的活化和增殖。 CD38−：CD38对应的基因是CD38，编码CD38蛋白，CD38在多种细胞类型中表达，在B细胞上，其表达水平可用于区分不同的B细胞亚群。CD38−表示细胞表面不表达CD38蛋白。 CD138−表示细胞表面不表达CD138蛋白 IGHD基因：该基因编码免疫球蛋白D（IgD）的重链。IgD主要作为B细胞表面受体的一部分，参与B细胞的活化和成熟。
78210编辑于 2025-06-24 - 来自专栏智能生信
使用 Benisse 解释单细胞基因表达的B细胞受体库
using Benisse 论文摘要 B细胞受体（BCRs）是B细胞发育和激活的关键角色，其成熟形式作为抗体分泌，执行中和入侵病原体等功能。 所有当前的BCR分析方法都只研究BCR序列，而忽略了它们与B细胞转录组学的相关性，从而得出关于BCR和B细胞作用的未知功能相关性的结论，并可能产生有偏见的解释。 许多单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术现在可以捕获每个B细胞的基因表达和BCR，这可能会解决这个问题。 在这里，作者用匹配的scBCR测序研究了来自13个scRNA-seq数据集的43938个B细胞，并观察到BCR与B细胞转录组学之间的关联。 作者发现在新冠肺炎感染期间，BCR和B细胞基因表达之间存在较强的耦合。并且与T细胞受体的趋同进化模式相比，BCR形成了连续和线性进化的定向模式，以实现最高的抗原靶向效率。
66610编辑于 2022-12-29 - 来自专栏流式抗体推文
从基础到临床：Elabscience APC 标记抗人 CD45RA 抗体[HI100]，全方位支持免疫研究
背景介绍CD45RA是一种205-220 kD单链I型糖蛋白。它是酪氨酸磷酸酶CD45的外显子4剪接变体。CD45RA亚型在静息/naïve T细胞、髓样胸腺细胞、B细胞和单核细胞上表达。 CD45RA增强T细胞受体和B细胞受体信号传导。CD45在T淋巴细胞和B淋巴细胞上与淋巴细胞磷酸酶相关磷酸蛋白（LPAP）非共价结合。 ）特异性结合 荧光检测：APC荧光染料在红激光（633-640 nm）激发下，在660 nm处产生发射光 信号分析：流式细胞仪检测荧光信号，从而鉴定和分选CD45RA阳性细胞群体 应用领域基础免疫研究 naïve T细胞与记忆T细胞的鉴定与分选 T细胞分化与激活机制研究 临床研究与应用 白血病免疫分型（如AML） 免疫功能评价 造血干细胞移植研究：CD45RA耗尽的外周干细胞移植可降低移植后病毒感染风险 AML survival via non-canonical NF-κB signaling and aberrant lipid metabolism (International Immunopharmacology
27710编辑于 2025-11-10 - 来自专栏微生态与微进化
Nature新技术分享：自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类
微流控分选的监控图，因为装置反光，光镊周围可以看到环形照明灯，CL为捕获区域，EL为评估区域，光镊在这两个区域之间往复移动 b-e. 氘标记细胞的分选过程，最终在评估区域释放被带入收集出口 f-i. RACS平台示例菌株及分选标准（a. 背景流体与标记和未标记的大肠杆菌细胞拉曼光谱比较，彩色条带分别展示了计算PC与PL所依据的波谱区域 b. 接下来评估分选准确率，作者将没有氘标记的大肠杆菌细胞用DAPI染色，并与氘标记的细胞进行1比1混合（附件图2b所示），然后输入平台连续一小时的运行分选，然后检测收集的细胞中DAPI染色细胞（也即未标记细胞 然后将小鼠结肠微生物组的细胞使用葡萄糖在有重水条件下进行培养，也即所有细胞都做氘标记，根据PL>6.14作为判断标记的标准进行分选，如附件图3b所示37%捕获的细胞被成功分选，这个效率可以与人工分选媲美 降解粘蛋白的标记细胞的判断标准及其分选结果 b. 粘蛋白降解的代谢通路及相关的酶 c.
1.4K30编辑于 2022-05-05 - 来自专栏生信喵实验柴
单细胞测序原理
一、细胞捕获分选技术 1.1 细胞分选技术 单细胞测序主要包括以下四个步骤。其中非常关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选，这是决定单细胞检测成本和通量的关键步骤。 单细胞测序分析流程图 不同单细胞测序平台主要差别也主要在于单细胞捕获分选的方法不同。在细胞分选的方法里，主要包括特异性分选和非特意性分选两类方法。 分别为： a：微吸管分离 b：显微镜辅助毛细管捕获 c：荧光标记细胞分选（FACS） d：激光捕获显微分离(LCM) e：微流控 几种常见单细胞分选技术比较 技术 微吸管分离 激光捕获显微分离 荧光激活细胞分选 抗体磁珠分选 微流控分选 微液滴分选 微孔分选 选择类型 特异性选择 特异性选择 特异性选择 特异性选择 非特异性选择 2.3 UMI UMI 是单分子识别码（Uniquemolecular identifier）的简称，一般是 10-12bp。UMIs 被认为是一个处理扩增偏好性的方法。
2.7K20编辑于 2022-10-25 - 来自专栏流式抗体推文
小鼠 Ly-49 家族检测难区分？Elabscience PerCP/Cyanine5.5 标记抗小鼠 Ly-49C/I 抗体精准靶向 C/I 亚型
Ly-49C[BALB]和Ly-49C[B6]同种抗原与b、d、k和s单倍型的MHC I类抗原结合，5E6抗体阻断这种结合。 Ly-49I[B6]与H-2[r]淋巴母细胞结合，与b、d、k、q、s和v单倍型的结合要弱得多。 ] 与 b、d、k、s 单倍型 MHC I 类抗原的结合，同时能识别 Ly-49I [B6] 与 r 单倍型 MHC I 类抗原的弱相互作用。 搭配 FITC 标记的 CD49b 抗体等标志物，可进一步提升细胞亚群分选的准确性。 应用领域PerCP/Cyanine5.5 标记抗小鼠 Ly-49C/I 抗体[5E6]仅适用于流式细胞术（FCM），广泛应用于以下研究方向：NK 细胞、NK-T 细胞的亚群分选与表型分析；Ly-49 家族受体表达调控与
33610编辑于 2025-11-21 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用
单细胞分选和测序分析 分选 传统的单细胞分选方法，如荧光激活细胞分选 (FACS)，不适用于 CTC 单细胞分选。 用于CTC单细胞分选的方法主要有显微操作分选法、微流控技术分选法、DEPArray和Cell Celector分选系统 微量移液器分离（micropipette isolation）涉及使用微机械机械手或视觉镊子完成单细胞分选的高倍显微镜 这种方法已在单细胞水平上用于研究乳腺癌和结直肠癌中的 CTC Cell celector 分选系统是一种自动分选系统，可将稀有细胞从混合细胞群中分离出来。 通过多功能机器人系统自动检索单细胞和细胞克隆，实现单细胞分选，直接机械分离目标细胞或克隆，不影响细胞活力，实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选；但是，这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA SNV 包括单碱基插入、缺失和突变。通过这些基因组结构变异，可以发现肿瘤驱动基因和生物标志物，也可以了解肿瘤发生的进程。
2.3K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏凋亡检测试剂盒推文
Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒，助力成果突破
内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒（货号：MIM003N），凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离，分选后细胞纯度高达 检测原理本试剂盒采用阴性分选技术实现 CD8+T 细胞的高效分离。 其核心原理是利用特异性抗体与样本中除 CD8+T 细胞外的其他细胞（如 CD4+T 细胞、B 细胞、单核细胞等）表面的标志分子结合，再通过磁珠（需搭配专用磁分离设备，如 EasySort™-5 Magnet 产品优势高纯度保障：分选后 CD8+T 细胞在 CD45 + 细胞群中占比达 93.4%，远高于分选前的 13.7%，满足高精度实验需求。 细胞活性优异：阴性分选技术不损伤目标细胞，分离后的细胞可直接用于下游培养、染色、功能检测等应用。适配性强：明确适用于小鼠脾脏和淋巴结样本，覆盖免疫研究常用组织来源。
31810编辑于 2025-09-22 - 来自专栏单细胞天地
结直肠癌中的B细胞单细胞图谱及临床情况
结论: 文章的研究对结肠癌中浸润B细胞的情况和相关临床结果提供了深入的见解。阐明B细胞的特征将扩大我们对其在结肠癌TME中的作用的理解，并支持开发新的B细胞靶向免疫策略。 根据CD19,CD45,CD27,CD38等基因对B细胞进行流式细胞分析证明B细胞的存在。 img 图上来看GC B细胞的一部分标志基因还包含Nacive B细胞的标志基因，这里也说明Nacive B 细胞和GC B 细胞的联系。 结肠癌肿瘤微环境中B细胞的细胞通讯 文章探究CD20+ B细胞与IgG浆细胞之间的差异。确定B细胞之间的两条信号通路CXCL13-CXCR5和CCL28-CCR10。 B细胞各亚群的功能和转录特征 GSVA通路分析显示记忆B细胞具有与naïve B细胞相似的功能，并富集抗原提呈和趋化因子信号通路激活，而浆细胞以蛋白质输出为特征。
1.2K10编辑于 2023-02-10 - 来自专栏生信技能树
为什么一个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因呢
小伙伴们跟着我们的单细胞数据分析流程，基本上都掌握了： 单细胞聚类分群注释 ，尤其是我们重点演示了的第一层次的分群。 b站免费视频课程 地址：https://www.bilibili.com/video/BV19Q4y1R7cu 很多小伙伴在实践我们的教程的时候，会注意到一个很有意思的现象，就是某个单细胞亚群既有T细胞也有 B细胞的标记基因，如下所示，其实很简单： 某个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因 可以看到， 这个cycling 亚群就是 既有T细胞也有B细胞的标记基因，实际上是因为它们这群细胞高表达 TOP2A 和MKI67基因，处于比较活跃的细胞增殖状态，这样无论它本身是 T细胞还是B细胞，它们的这个状态使得它们在普通的降维聚类分群的流程里面就会被混合在一起。 一般来说，这样的细胞亚群，我们直接命名为一个个cycling 亚群即可，在今年（2021）年初的文章《A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1
1.5K20发布于 2021-11-23 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序揭示阿尔兹海默症的B细胞相关标志物
（2）流式细胞分选 来自43个AD病人与41个Normal的PBMC样本 结合AD病人的Clinical Dementia Rating (CDR) scores，进一步确认B细胞比例变化与AD进程的关系 文章发现B、CD8+、NK的上调基因均能富集到AD的通路，但是B细胞的AD富集程度排名最好，所以进一步确定了B细胞的潜在意义。 downregulated genes （2）结合流式分选结果，分析AD病人外周血细胞比例 AD与Nomral的B细胞比例具有显著差异； AD病人的CDR评分与B细胞比例呈负相关 LpgWIQ.png 之后结合流式分选与动物实验进一步说明了B细胞在AD进程中的关键性作用。感觉思路是非常清楚的，而且也很完整。 但也存在一点疑惑：从文章展示的样本scRNAseq细胞类型比例来看，我觉得AD/Normal的B细胞类型比例差异并不明显。可能这也是为什么补充了流式分选的另一个意义吗？
1.4K60编辑于 2022-03-14
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