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AI 在筛查消化道早期癌症的应用
我们的第一个切入点是消化道早期癌症筛查。消化道肿瘤发病率占我国癌症发病率的39%，5年生存率低于80%，而这类肿瘤若能早期发现，治愈率高达95%。 自2017年8月从食管癌筛查起步，我们在病种上不断突破，已串联起整个消化道（食管癌，胃癌，结直肠癌）AI筛查解决方案，在技术上不断深入不断提升准确率，并且在医生实际体验上不断优化。 我们的第一个切入点是消化道早期癌症筛查。消化道肿瘤发病率占我国癌症发病率的39%，5年生存率低于80%，而这类肿瘤若能早期发现，治愈率高达95%。内镜检查是消化道病变筛查和诊断的常用检查手段。 由于消化道疾病本身的复杂程度，和医生操作的人为因素，内镜检查漏诊率高（美国高达27%，中国更不容乐观）[1]，意味着很多患者错过了最佳治疗时机。 在“腾讯觅影-上消化道筛查”的胃镜图片良恶性分类任务的开发中，就遇到了这样的噪音标签问题（上图右），使用蒸馏方法后，我们有效的利用了噪音标签提升了准确率。
2K2725发布于 2020-04-14 - 来自专栏机器学习AI算法工程
支持向量机SVM入门详解：那些你需要消化的知识
出自：嘉士伯的Java小屋 http://www.blogjava.net/ （一）SVM的八股简介 支持向量机(Support Vector Machine)是Cortes和Vapnik于1995年首先提出的，它在解决小样本、非线性及高维模式识别中表现出许多特有的优势，并能够推广应用到函数拟合等其他机器学习问题中。 支持向量机方法是建立在统计学习理论的VC 维理论和结构风险最小原理基础上的，根据有限的样本信息在模型的复杂性（即对特定训练样本的学习精度，Accuracy）和学习能力（即无错误地识别任意样本
1.6K80发布于 2018-03-14 - 来自专栏生物信息云
细胞传代实验
弃去 PBS,按每 25 平方厘米 1ml 消化液比例加入消化液，消化液中 EDTA 浓度视不同细胞而定，骨髓干细胞贴壁特性强，比较难于消化，可提高 EDTA 浓度的方法，本实验采用0.25%胰蛋白酶加 0.1%EDTA 的消化液证明可以很好地消化，并不会损伤细胞。 放入显微镜下观察，待所有细胞变圆后立即拿入超净台内，加入 6ml 细胞完全培养基终止消化。消化时间为 1-5 分钟，具体依细胞而异。 2、适度消化： 消化的时间受消化液的种类、配制时间、加入培养瓶中的量等诸多因素的影响，酶解消化过程中要不断观察，消化过度会对细胞造成损害，消化不够则难于将细胞解离下来。 3、 把握好消化液的最佳浓度： 消化液的消化能力是和溶液的 pH、温度、胰酶浓度及溶液中是否含有 Ca2+, Mg2+和血清等因素有关， 实验采用 0.25%胰蛋白酶+0.1%EDTA 的消化液证明可以很好地消化骨髓干细胞
1.4K20发布于 2019-09-17 - 来自专栏iPSC诱导多能干细胞培养
干细胞培养中的组织解离难题：胶原酶选择、工艺优化与残留控制实践
摘要：干细胞传代培养和原代细胞分离过程中，组织解离与细胞消化是影响细胞活率、结团率和后续培养质量的重要环节。 衍生细胞传代培养过程中，组织解离与细胞消化往往是最容易影响最终细胞质量的关键步骤之一。 消化不足可能导致细胞释放不充分、得率下降，而过度消化又可能损伤细胞膜结构、影响细胞表面标志物表达，甚至降低细胞活率和后续扩增能力。 对于部分iPSC来源细胞或三维培养体系细胞而言，合理的酶体系选择往往比单纯延长消化时间更加有效。图1. 文中涉及的组织解离、胶原酶应用、细胞消化工艺及残留检测方法等内容，主要用于介绍细胞培养和细胞治疗研发过程中常见的工艺优化思路。
11510编辑于 2026-06-18 - 来自专栏细胞培养
化学成分限定MSC培养基使用指南：储存、培养参数与无血清传代操作规范
图1.SolallisMSC扩增培养基，化学成分限定二、化学成分限定培养体系中的细胞消化与传代相比传统含血清培养体系，CDM体系在细胞消化传代过程中最大的特点是不具备天然终止消化酶活性的能力。 因此，在进行细胞收获和传代时，需要特别关注消化终止和后续清洗步骤。2.1CDM体系为什么需要额外终止消化传统含血清培养基中含有多种蛋白成分，可以在一定程度上中和胰蛋白酶等消化酶活性。 而化学成分限定培养基中不含这些天然抑制成分，因此消化酶在加入培养基后可能继续保持活性。如果未及时终止消化，残留酶可能持续作用于细胞表面蛋白，影响细胞贴壁、生长以及后续扩增效果。 不同消化体系对应的终止方式有所差异，应根据消化液组成进行合理选择，并充分评估终止试剂对细胞状态的影响。 2.4为什么需要充分洗涤细胞在CDM体系中，完成消化和终止步骤后，建议使用无菌PBS或其他适宜缓冲液对细胞进行充分洗涤。首先，残留消化酶可能持续作用于细胞膜表面蛋白，影响细胞贴壁能力和后续增殖。
10610编辑于 2026-06-23 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序中子宫内膜细胞悬液制备
注 | 以上操作指南中涉及的消化酶以及实验方法仅供参考，实际应用过程中请根据自己的组织样本类型进行细节上的调整。 背景介绍 子宫内膜由单层柱状上皮和固有层组成。 上皮由纤毛细胞和分泌细胞构成，但分泌细胞多于纤毛细胞。 固有层很厚，由疏松结缔组织构成，含有较多网状纤维、巨噬细胞、淋巴细胞和浆细胞，丰富的血管、淋巴管和神经，此外，还有大量分化程度较低的梭形或星形细胞，称基质细胞。 重悬后的组织加入10mL消化液，37°，摇床200转消化30分钟。 使用100μm细胞过滤器过滤细胞悬液。 组织用10mL消化液重悬后继续消化，37°，摇床200转消化30分钟。 步骤6中的组织消化后按步骤5，收集细胞过滤液，离心并用DMEM/FBS重悬后放置在冰上。组织则继续加入10mL细胞消化液消化，条件不变。 重复步骤8两次，消化时间改为20分钟。
74830发布于 2021-10-09 - 来自专栏大数据杂货铺
如何消化每天 150 亿条日志，让大查询保持在 1 秒内
该数据仓库用例与规模有关。用户是中国联通，全球最大的电信服务提供商之一。使用 Apache Doris 在数十台机器上部署多个 PB 级集群，以支持 30 多个业务线每日添加的 150 亿条日志。如此庞大的日志分析系统是网络安全管理的一部分。出于实时监控、威胁追踪和警报的需求，用户需要一个能够自动收集、存储、分析和可视化日志和事件记录的日志分析系统。
1.3K20编辑于 2023-09-28 - 来自专栏单细胞天地
单细胞转录组揭示人类胚胎肠道发育过程中自噬相关的基因动态表达
但是，自噬在人类胎儿消化道发育中的作用尚未有研究报道。本研究，使用超过5000个从6周到25周不等的人类胚胎消化道细胞，从单细胞水平探索了自噬相关基因的动态表达，并发现自噬相关基因的转录活性显著增强。 因此，我们通过单细胞基因表达分析全面检查了人类胚胎消化道发育过程中自噬相关基因的动态表达，为揭示自噬与人类胎儿消化道发育的关系提供了一个新的视角。 有趣的是，有趣的是，在人类胎儿小肠发育的第9周，几乎所有细胞（87个细胞中的86个）都表达了人类四个胎儿消化道器官所有阶段的大部分自噬相关基因（图1A， S1B和S1C），聚集在第15组中。 临床意义 自噬是维持细胞内环境稳定所必需的，并且参与器官发育的调节。虽然，人类胎儿消化道发育的潜在机制尚未被揭示。 通过对单细胞RNA测序数据的全面的生物信息学分析，我们首次揭示了人类胎儿消化道发育过程中自噬相关基因的动态表达。综上所述，我们的研究有助于进一步阐明自噬与人类胎儿消化道发育之间的复杂机制。
1.2K20发布于 2020-03-27 干货分享 | 细胞铺板有哪些被忽略的小妙招？ | MedChemExpress (MCE)
细胞消化：将细胞进行传代，弃去培养基，取适量的 PBS 轻轻润洗 2-3 次，吸尽上清。 加入适量的胰酶置于 37℃ 培养箱中消化 (消化时间根据细胞类型而定)，待细胞皱缩且间隙变大、可从皿底滑落且不聚团成块时即可加培养基终止消化。 小贴士：应随时观察细胞消化状态，消化时间太短或太长都会影响细胞状态哦~三、细胞计数将终止消化的细胞轻轻吹打，使细胞完全从皿底脱落。 根据实验目的，适时进行细胞处理 (如药物添加、转染等)，并继续观察细胞。02常见问题及可能原因一、铺完细胞后状态不佳可能性原因：1. 细胞的消化时间过长导致细胞损伤，会影响细胞的生长和代谢功能；2. 检查培养基，优化培养环境，确保用来铺板的细胞传代次数不多，细胞活力好。二、细胞密度不均匀可能性原因：1. 细胞的消化时间过短或过长，导致细胞消化不充分或细胞结团率太高；2.
91611编辑于 2024-10-21- 来自专栏芒果先生聊生信
芒果实验室，293细胞培养
HEK293T细胞由HEK293细胞衍生而来，含有SV40 large T抗原，贴壁不牢。293T细胞表达 E1A蛋白，S40大T抗原，含有S40复制起始点与启动子区的质粒可以复制。 细胞培养犹如带娃，什么时候喂奶（传代），什么时候尿尿（换液），什么时候拉臭臭（冻存），必须要规律。技巧就是，每隔两天，固定时间传代，传代的细胞量，培养基和条件要一致。 3.从培养箱内取出细胞：镜下观察细胞状态。 （二）胰蛋白酶消化： 1.加入消化液：小心吸出旧培养液，用PBS清洗后再小心吸出，加1000ul胰蛋白酶消化液（10cm培养皿）。 2.消化情况判断：肉眼观察细胞底部脱落，表明此时细胞消化适度。 3.加入培养液：加入2ml新鲜培养液，用1000ul移液器吹打细胞，并转移至事先准备好的15ml离心管，1000转/分钟离心4分钟。 （三）分装培养细胞： 1. 弃上清液，加入新培养液：吸出旧培养基，加2m新鲜培养基，用1000ul移液器吹打细胞，吸放5次制成细胞悬液。
1.2K30发布于 2020-06-28 - 来自专栏生信菜鸟团
细胞凋亡—流式细胞仪检测
，轻轻吹打，加入冰冷的DMEM(含10%(v/v)的小牛血清)3.0ml，终止消化。 对于贴壁细胞，先用胰酶消化，再用PBS液洗涤。将细胞重悬于200μl Binding Buffer。 必须活细胞检测，不能用能破坏细胞膜完整性的固定剂和穿透剂固定或穿膜。 2. 特殊细胞的染色方法：在消化或吹打时，有些细胞（如神经元细胞）很容易受到损伤，导致晚期凋亡或坏死比例非常高，不能反映真实结果。 实验的解决方法：先低速离心，吸取细胞培养板中的液体，留少许液体，加入适量PI和Annexin-V染色10min后，将漂浮细胞吸至离心管中，离心洗涤两次，用PBS漂洗贴壁细胞两次，加胰酶消化后将细胞悬液移至另一离心管中 由于Annexin-V为钙离子依赖的磷脂结合蛋白，只有在钙离子存在的情况下与PS的亲和力才大，因而在消化细胞时，建议一般不采用含EDTA的消化液。 4. 必须设置阴性对照和补偿对照（分别单染）。
1.1K10发布于 2021-11-15 - 来自专栏单细胞天地
培养细胞单细胞悬液制备
背景介绍 一般细胞培养分为悬浮培养和贴壁培养，由于细胞的增殖有可能形成大小不等的细胞团块或连接成片。 活体体内细胞当离体置于体外培养时大多数以贴壁方式生长，主要包括正常细胞（例如：成纤维细胞、巨噬细胞、神经胶质细胞、心肌细胞以及肝、肺、肾、乳腺、皮肤细胞等）和肿瘤细胞，一般用胰酶消化；临床上常见的脱落细胞经过简单离心过筛处理就能制备成单细胞悬液 人培养细胞示意图 材料和试剂耗材 实验流程 贴壁细胞： 将培养细胞用0.25 % ~ 5 % 胰蛋白酶消化1 ~ 5 min（根据室温情况而定），至光镜下见到贴壁细胞间出现筛状间隙为止，弃去消化液，加 弃上清，加pH 7.4的PBS液5~8 mL，低速短时离心，800~1000 r/min 离心3~5 min；重复 2~3次，以去除细胞悬液中的细胞碎片。 加少许PBS液，将沉淀细胞轻轻吹打均匀。 ； 加少许PBS液混匀沉淀细胞，加固定液或低温保存备用。
1.1K30编辑于 2022-03-14 流式细胞术凋亡检测指南 | 实验原理、步骤与结果分析详解
-方法一（推荐）：加入适量不含EDTA或含低浓度EDTA的胰酶（如Accutase）消化，时间尽量短（通常30秒-1分钟），待细胞刚刚开始变圆松动时，立即加入含血清的培养基终止消化。轻柔吹打收集细胞。 （避免过度消化损伤细胞膜）-方法二：用预冷的PBS洗涤后，直接用预冷的细胞刮刀轻柔刮下细胞，收集到离心管中。（物理方法可能增加机械损伤）悬浮细胞：直接离心收集细胞（通常300g,5分钟），弃上清。 如果实验操作非常小心，这个象限的细胞比例应该很低；高比例可能提示样本处理不当（如过度消化或吹打）或样本本身包含大量原发坏死细胞。 胰酶选择贴壁细胞消化首选不含EDTA或含低浓度EDTA的温和消化酶（如Accutase），并严格控制消化时间。EDTA会螯合钙离子，而AnnexinV结合PS需要钙离子！ 严格把控胰酶消化时间（无EDTA酶）、钙离子浓度、避光染色与多重单染补偿对照，确保象限划分绝对准确。✔专业平台，数据可靠无忧高端仪器保障：采用主流流式细胞仪，确保检测灵敏度和稳定性。
1.1K10编辑于 2025-11-13- 来自专栏单细胞天地
小鼠皮肤组织细胞悬液制备流程
注 | 以下操作指南中涉及的消化酶以及实验方法仅供参考，实际应用过程中请根据自己的组织样本类型进行细节上的调整。 在冰上搅拌20分钟后，用移液管将消化混合物转移到2mL的均质器中。使用杵棒A搅打2 min (共4个循环，8分钟)。消化液此时会变得混浊。 过滤后的溶液在冰上保存，过滤器用于接下来的第二次消化过程。 在步骤8留下来的沉淀中加入1mL B. Lich酶解液。 每2分钟研磨10次，每分钟摇动一次，同时在冰上再孵育20分钟。 使用台盼蓝进行细胞计数。 通过细胞计数仪检测细胞活性大于等于85%，背景干净，结团率小于5%，细胞量大于等于5万；可用于后续单细胞测序建库实验。 我们可以通过DNAseI和其他类型胶原酶辅助解离降低结团率，或者通过结团细胞团和单个细胞间沉降系数差进行离心沉降，从而获取低结团的细胞悬液。
2.3K20发布于 2021-10-22 - 来自专栏百味科研芝士
23分多组学文献：胃肠腺癌的分子比较分析
而单核苷酸高突变亚型在上下消化道也表现出免疫信号表达的异质性：在CRC中发现白细胞抗原表达减弱、NK细胞基因表达显著升高，这也提示了，增强NK活性的药物可能是治疗单核苷酸高突变亚型的一种选择。 图4A热图展示了CIN亚型和GS亚型中体细胞拷贝数变异景观，可以发现在上消化道和下消化道拷贝数变异的总体模式是类似的，但与CRC相比，在GEA中，体细胞拷贝数变异的景观看起来显示出一个更精细的片段化基因组 本文还探究了CIMP状态与CIN肿瘤中体细胞拷贝数变异事件的相关性，将上消化道CIN肿瘤分层为CIMP和非CIMP，分别计算非整倍性分数，但并没有发现两者之间的相关性(图S4E)。 文章接着探讨了上消化道CIN-F和CIN-B肿瘤对通路的不同影响，结果发现CIN-F肿瘤中编码酪氨酸激酶受体、KRAS和细胞周期介质的基因的局灶性扩增更频繁。 在下消化道中，CIN- f和CIN- b肿瘤的体细胞突变频率整体差异并不大，特别是APC和KRAS突变。但是，PIK3CA突变和TGF-β通路改变在CIN-B 中更常见(图S4I)。 ?
2.9K31发布于 2020-06-09 - 来自专栏单细胞天地
人-软骨组织单细胞悬液制备
将软骨碎块转移至50 mL管中，管中加入胶原酶消化混合物（10 % v/v 软骨：消化混合物），在37°C振荡（45-60 rpm）孵育软骨-胶原酶混合物12-15 h。 消化完成后，将离心管至于冰上，将混合物通过70 μm细胞筛过滤。并用预冷培养基清洗滤网。 300g ，4℃离心5 min。 使用预冷的培养基洗涤沉淀，重悬，并重复离心步骤。 在1mL预冷的缓冲液中重悬细胞，直至沉淀完全重悬。并通过移液吹打彻底混合。 质检，计数细胞并使用台盼蓝检验细胞活力。 如有较多红细胞，则需再做裂解红细胞处理： 重悬细胞沉淀，加入2 mL红细胞裂解液，室温下裂解2 min，以去除剩余红细胞。 加入10 mL预冷的缓冲液抑制红细胞裂解液的活性。 注：软骨组织较坚韧，解离过程中需注意充分消化
1.2K30发布于 2021-10-20 - 来自专栏单细胞天地
脑组织单细胞悬液制备流程
，因此主要用于细胞集落的分离和将组织块分解成小块细胞，因为它保持细胞膜的完整性，其温和的蛋白水解作用使酶可以被特异性用于分离原代细胞和次级细胞（亚培养）。 脱氧核糖核酸酶 I用于消化游离的DNA，防止细胞团聚，同时不损伤细胞。 注：在此步骤中可以使用不同的酶消化溶液混合物。我们还使用了终浓度为25 µg/mL的Liberase DH。 2.4、通过无菌滤膜（0.22 μm）过滤蔗糖和酶消化溶液。 3.7、吸出上清液，加入预热的酶消化液，每1 mL组织加入5 mL消化液。 3.8、用封口膜密封离心管盖，并在37℃下旋转孵育20 min。 3.10、用1000 μL移液器，再吹打6-8次，冰上静置，将未能消化的组织块沉降到离心管底部。
2.5K10发布于 2021-10-09 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序中小鼠肝脏组织细胞悬液制备流程
肝细胞为多角形，有6-8个面，不同的生理条件下大小有差异，如饥饿时肝细胞体积变大。每个肝细胞表面可分为窦状隙面、肝细胞面和胆小管面三种。 在离心管中加入5mL预冷的DPBS，稀释胰蛋白酶混合液，终止消化。 将步骤 7 中剩余的组织块加入组织解离酶（5mg/mL，胶原酶 IV 0.8mg/ml，DNase I 0.5mg/ml），置于37℃ 的摇床上 80rpm/min进行解离； 消化 8-12min之后 ，加入两倍体积的 DPBS稀释终止消化，取出离心管，涡旋仪上，轻微涡旋2-3次（2S/次）。 将终止消化后的酶及细胞混合物分别通过 70μm和40μm的细胞筛，下清液离心收集细胞。 在4°C下旋转300 g 离心5 min，除去上清液，使用DPBS（含1% BSA）重悬细胞，置于冰上备用。
3.7K30发布于 2021-10-09 - 来自专栏生物信息云
细胞冻存实验
细胞生物学研究中，为了更好而长期地研究细胞生物学功能，需要将良好状态的细胞保存起来，以备将来使用。 在不附加任何保护剂下直接冻存细胞时，细胞内和外环境中的水都会形成冰晶，能导致细胞内发生机械损伤、电解质升高、渗透压改变、脱水、 PH 改变、蛋白变性等，能引起细胞死亡。 二、胰蛋白酶/EDTA 消化 从细胞培养箱中取出细胞， 进行瓶口消毒，弃去细胞原来的培养基。 按每 25 平方厘米 1 毫升胰酶/EDTA 消化液比例加入消化液，放入显微镜下观察，待所有细胞变圆后立即拿入超净台内，加入两毫升细胞完全培养基以立即终止消化。 三、细胞计数采用罗氏 CASY-DT 快速细胞计数及活率分析仪进行细胞计数。
1.7K20发布于 2019-09-17 - 来自专栏生物信息云
染色质免疫沉淀(ChIP)实验(附视频)
接下来进入实验部分，本实验操作流程为：首先用甲醛处理细胞，使蛋白质与 DNA 交联，然后用微球菌核酸酶进行消化，进行免疫反应之后，解除蛋白质DNA 的交联，最后回收得到的 DNA。 甲醛处理使蛋白质与 DNA 交联 在实验前需将待用细胞，用胰酶消化，进行细胞计数后，调整细胞密度到所需的密度后，方可进行实验。 细胞裂解并用微球菌核酸酶进行消化 Micrococcal Nuclease 可以将染色质切成一到几个核小体，比常规的超声波处理的结果更精致，更均一。 ChIP 的实验结果易受细胞数量多少、交联时间长短、消化片段大小、抗体的种类等多种因素影响，所以在做 ChIP 实验时，必须做好实验对照，否则难以对实验结果的可靠性进行判断。 同时，还需要优化 Micrococcal Nucleas 消化步骤，增加酶量或是减少细胞的数量。相反，若细胞与 Micrococcal Nuclease 比例太低，就会造成片段过短。
2.9K22发布于 2019-09-17
腾讯云开发者
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