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需要注意,Visium spot 通常包含多个细胞。Seurat 标签转移给出的是参考细胞类型与每个 spot 的相似性分数,可以将最高分对应的细胞类型作为该 ...
下载自 https://www.dropbox.com/s/cuowvm4vrf65pvq/allen_cortex.rds?dl=1
数据来自10X官方网站,也可以从SeuratData获取。InstallData会安装R包,如果已安装,运行这句代码不会导致重复安装。
小蜜最近换了台电脑,每次打开 RStudio 都会弹出 n 道提示,最后忍无可忍修改了设置😊
最近不少同学在通过 install.packages("regplot") 安装时,遇到了这样的warning:
最近在准备python暑假班的备课,本期计划使用docker了。然后呢,我自己装完docker后发现C盘爆红了。
小编最近关注到环境毒理学与癌症有密切关系,我们找了 8 篇文献,从 3 分的基础生信到 10 分以上的机制大作都有,今天咱们就来盘一盘,看看低分到高分的文献是怎...
看着这堆红色的报错,我整个人是懵的。文件明明在那里,大小也正常,这个 <ff><fe> 到底是个什么外星语?
作为一只资深的R语言讲师,我们做富集分析从来都是ClusterProfiler伺候。因为与R语言其他分析的完美衔接,也因为Y叔超强的开发能力和独特的人格魅力。
做点数据处理和可视化,需要编程基础;做出来图表,需要解读和文献验证,又是大把的时间啊。 来自巴基斯坦费萨拉巴德政府大学的Muhammad Tahir ul Qa...
应该是会经常遇到这样的热图,就是说它的聚类情况无法与分组信息吻合。其实这个并不是错了,是因为用于聚类的行(选出的这部分基因)的表达模式在两组之间没有明显区别。
之前演示了如何使用meta分析整合多次差异分析结果,本文演示如何用RRA算法整合。
画图课程如火如荼的内测ing~~~大家的学习热情高涨,我们也在随时收集大家喜欢的图。今天的图是直播课学生许愿的:
最近在筹备R语言画图课程,目前正在内测,因为只发了一下朋友圈和内部群就已经很多人了,就没有发在公众号。等我们根据内测的反馈打磨一番再拿出来给大家品鉴哦,可以蹲守...
优点:逻辑简单,读者一看就懂。 缺点:存在严重的**“漏斗效应”**。很多基因可能在一个数据集中显著(P<0.05),在另一个数据集中处于边缘显著(比如 P=0...
GSE309870是个转录组数据,他的表达矩阵的编码方式有问题,传统的几个读取方式都扑街了,encode参数只能和设置 latin1、UTF-8、bytes、u...
我把函数的源代码拆出来运行,发现这个报错出自PCA函数,就是计算PCA的时候报错。好了,分分钟排除掉了自己的嫌疑!哈哈哈哈。
条形图是一种常见的数据可视化工具,它通过长方形的长度来表示数据的大小。在实际应用中,条形图有多种形态,不只是展示比例,还可以展示数量,每种形态都有其独特的使用场...
学生说想要在Rstudio的Tools-Global Options里面设置西湖大学的镜像,但是在软件提供的镜像列表里面找不到西湖大学。
这不是网络问题,这是没钱了,GEO网站头部的条说了。但还好,数据页面可以正常使用,最近群众发现可以曲线救国一下,从隔壁进去:
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