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来自专栏细胞培养
刀豆蛋白A磁珠（Concanavalin A磁珠）应用解析：BioMag Plus ConA在糖蛋白富集与CUT&RUN（Cut&Tag）中的应用
BioMag Plus ConA磁珠通过将Con A共价偶联至磁性微球表面，实现了快速、高回收率的糖基化分子富集，同时也可用于细胞核捕获以及CUT&RUN、CUT&Tag等实验流程。在表观遗传研究领域，ConA磁珠能够高效捕获细胞及细胞核，因此成为CUT&RUN、CUT&Tag以及相关染色质分析流程中的常用工具。相较传统ChIP流程，其能够降低背景噪声，并减少样本需求量。主要用于糖蛋白、多糖以及糖肽富集，同时也能够用于细胞核捕获以及CUT&RUN、CUT&Tag等表观遗传实验流程。Q2：为什么实验体系必须加入Ca²⁺和Mn²⁺？ Q3：可以用于CUT&RUN实验吗？可以。ConA磁珠能够高效结合通透细胞及细胞核，因此已被广泛应用于CUT&RUN相关流程。Q4：适用于哪些样本？ polysciences-microspheres/86057-3.shtml关于技术来源本文基于刀豆蛋白A磁珠、BioMag Plus Concanavalin A、Con A磁珠、糖蛋白/多糖富集磁珠、CUT
1300编辑于 2026-05-21
探索ImmGen: 3-查询小鼠基因表观遗传修饰
在ImmGen 的Chromatin模块，不同组织不同免疫细胞发育阶段或刺激后的开放染色质区域ATAC-seq数据、组蛋白修饰CUT&RUN以及转录因子分析。
14210编辑于 2026-01-27
来自专栏智能生信
[Bio | 论文简读] DiffChIPL：一种基于limma的具有生物复制的高通量测序数据的差异峰值分析方法
DiffChIPL 在真正的 ChIP-seq、CUT&RUN、CUT&Tag 和 ATAC-seq 数据集上也表现良好。
53920编辑于 2022-12-29
来自专栏用户7627119的专栏
CUT&Tag：DNA-蛋白质互作研究“革新”技术，引领微量细胞表观遗传学
2017年，美国Fred Hutchinson癌症研究中心的Steven Henikoff团队基于ChIC技术开发了CUT&RUN（Cleavage Under Targets and Release 其原理与CUT&RUN类似，首先通过刀豆蛋白A包被的磁珠（ConA beads）吸附细胞（与细胞膜上的糖蛋白结合），通过洋地黄皂苷在细胞膜上“打孔”，在抗体引导下，转座酶精准靶向目的蛋白。 02 CUT&Tag数据展示 Henikoff等通过传统ChIP-Seq、CUT&RUN、CUT&Tag三种方法对K562细胞中组蛋白修饰H3K27me3进行研究，结果显示，在相同的数据量（8M Reads
2.1K10编辑于 2022-09-21
来自专栏医学数据库百科
2022.03在线数据库汇总
SEAseq是一个用来分析Chip-seq/CUT&RUN的数据库以上就是，这个月的在线数据库了。有需要的，后台回复 2203 哈。
1.2K10编辑于 2022-05-17
来自专栏生信宝典
Genome Research封面文章｜张勇课题组开发方法绘制胚胎发育早期转录因子结合位点图谱
该工作在K562细胞中验证了FitCUT&RUN的有效性和可靠性，且相较于CUT&RUN、FLAG-CUT&RUN、ChIP-seq具有更高的检测灵敏度，适合于胚胎发育早期的研究。
55930编辑于 2022-03-27
来自专栏生信菜鸟团
CutRun and CutTag——Linux篇
最近课题有用到Cut&Tag和Cut&Run，所以这周推文想分享一下Cut&Run上游分析。
3K31编辑于 2023-10-30
来自专栏生信菜鸟团
分享一个Steven Henikoff 课题组做出来的新技术—sciCUT&Tag
❝今天来分享一个曾老师分享给我的，近期发表的 single-cell CUT&Tag (sciCUT&Tag) 技术，前一段时间我还在分析Cut&Tag和Cut&Run的数据，转眼就有新的技术更新了，仍然还是
1K30编辑于 2023-11-17
来自专栏数据科学（冷冻工厂）
CUT&Tag 数据处理和分析教程（8）
SEACR call Peak SEACR（用于 CUT&RUN 的稀疏富集分析工具包）专为从染色质分析数据中识别峰值和富集区域而设计。
61110编辑于 2025-04-30
顶刊分享--激活的ATF6α是限制免疫监视的肝脏肿瘤驱动因子
直接结合证据：CUT&RUN实验证实nATF6α直接结合于FBP1启动子区域；ATAC-seq显示FBP1位点染色质可及性降低，提示表观遗传沉默。
39020编辑于 2026-02-21
来自专栏生信菜鸟团
期刊泛读 | Cancer_Cell | 第 1 期 | If 48.8
数据表格数据资源获取方式 WGS, RNA, and H3K27me3 CUT&RUN sequencing data Deposited on the NCBI Gene Expression Omnibus SRR27620041-27620042 Bulk RNA-seq data Can be accessed from Sequence Read Archive: SRR27027798-28027803 CUT
57200编辑于 2025-02-03

刀豆蛋白A磁珠（Concanavalin A磁珠）应用解析：BioMag Plus ConA在糖蛋白富集与CUT&RUN（Cut&Tag）中的应用

探索ImmGen: 3-查询小鼠基因表观遗传修饰

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Genome Research封面文章｜张勇课题组开发方法绘制胚胎发育早期转录因子结合位点图谱

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期刊泛读 | Cancer_Cell | 第 1 期 | If 48.8

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