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有代码 | Nature | 转移性胰腺癌中转录组可塑性的空间映射
值得注意的是,在12名患者中有8名患者(排除没有腹膜转移的患者Pt-5),原发灶(Pri)和腹膜转移灶(PerM)表现出更紧密的层次关系(图1d,e)。 ◉ d,具有两个肝转移灶的 Pt-7(左上)、Pt-5(右)和 Pt-9(左下)的系统发育树显示其推断的 CNV 谱相似(Pt-7)或不同(Pt-5 和 Pt-9)。 ◉ c–e,在三个代表性病例中对肿瘤谱系组成的可视化空间展示,揭示了Pt-9(c)、Pt-5(d)和Pt-13(e)从原发灶到转移灶的谱系状态转变。 相比之下,尽管Pt-5患者的两个肝转移灶(LiMs)包含两个不同的克隆(图2d),但它们表现出相似的谱系状态组成,其特征是基底样和中间谱系状态丰富(图3d)。 这些样本包括来自Pt-5和Pt-8的原发肿瘤及其匹配的同时性肝转移灶,以及Pt-13的原发肿瘤。
每种组织的新鲜切片厚度为5微米,被置于载玻片中央位置,每个样本覆盖两张载玻片。