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  • 【分子生物学】单基因遗传突变造成的蛋白质三级结构变化-从NCBI到swissmodel到pymol实操

    操作步骤 1.获取基因的蛋白质序列 1.1 NCBI网站获取DDX58蛋白序列并进行同源性比较 在NCBI数据库中选择【protein】选项,输入DDX58后,自动默认选择为人类DDX58,然后点击中间 https://swissmodel.expasy.org/interactive 2.网站Swissmodel获得DDX58蛋白三维结构图 2.1 将DDX58氨基酸序列输入到文本框,可填写project 3.Pymol软件下进行DDX58蛋白三维结构及109号氨基酸氢键互作可视化 3.1 FIle 目录下导入DDX58 蛋白的PDB文件。 3.2 找出109号氨基酸与DDX58蛋白其他氨基酸氢键相互作用。 DDX58蛋白109号氨基酸从ARG精氨酸变成 后的氢键互作改变可视化 4.1 新建一个DDX58的对象。

    50410编辑于 2025-10-20
  • 来自专栏全栈程序员必看

    java打开dex文件_dex文件反编译工具(Dedexer)

    二,把dex文件按照java源代码package的目录结构建好了目录,每个class文件对应一个ddx文件。不像dexdump那样把所有的结果都放在一起。 使用指南: 为了方便,我把ddx1.5.jar放入system32中,运行CMD.输入如下命令: D:\WINDOWS\system32>java -jar ddx1.5.jar Usage: java -jar ddx.jar -o -D -d :指定生成的文件放置的目录 :dex源文件. 运行结果,出现一个使用帮助.仔细阅读后试了下: java -jar ddx.jar -o -D -d java -jar ddx1.5.jar -o -D -d c:\dex\gen c:\dex\classes.dex 示例: D:\WINDOWS\system32> java -jar ddx1.5.jar -o -D -d c:\dex\gen c:\dex\classes.dex Processing com/

    2.1K30编辑于 2022-09-14
  • 来自专栏生信探索

    安装一个不存在的R包

    468 DDX11L10 # cg26978960 4 666 0 DDX11L10 # cg03792876 5 666 9152 DDX11L10 # cg09699726 6 14930 5375 POLR3K uc010bqm.2 # cg01686861 2 1033 805 DDX11L10 uc010bqm.2 # uc010bqm.2 # cg01686861 2 799 805 DDX11L10 uc010bqm.2 # cg05558259 3 799 468 DDX11L10 uc010bqm.2 # cg26978960 4 799 904 DDX11L10 uc010bqm.2 # cg03792876 5 799 11687 DDX11L10 uc010bqm

    1K50编辑于 2023-03-03
  • 来自专栏Dissecting Unreal

    用UE4/UE5的ddx/ddy做描边

    正好虚幻材质里有ddx/ddy这两个节点,可以直接算相邻像素的差值,而且有硬件的Buff加持,所以比自己手动偏移UV再采样贴图要省很多开销,除此外连连看也比传统描边做法简单很多,下面是具体做法。 ddx/ddy 文档上的说明如下: 虚幻引擎工具类材质表达式 | 虚幻引擎5.0文档 (unrealengine.com) ddx是右减左的差值,ddy是下减上的差值。 ddx/ddy为什么速度快呢? 内部硬件怎么实现的我也不清楚,查各种资料看到是说因为ps通过SIMD指令一次算完一个quad里的所有像素,其实就是2x2的格子,因为quad内的所有像素都在同一个寄存器内,另外又因为GPU为了计算mips一定会计算ddx /ddy,所以顺便把这个信息暴露出来给shader用,无论怎样ddx/ddy内部都会做一次,所以shader复用这个结果是免费的。

    2.2K10编辑于 2022-09-28
  • 来自专栏程序员叨叨叨

    8.4 CG 标准函数库

    下面我们带着问题来学习这两个函数: 函数 ddx 和 ddy 是做什么用的,即对输入参数进行了哪些处理? 函数 ddx 和 ddy 的输入参数的意义?是纹理坐标,还是颜色值? 函数 ddx 和 ddy 输出量表达了何种含义? 上面这句话的意思是,如果函数 ddx 的参数为 myVar,该参数对应的像素点记为 p(i, j),则 ddx(myVar)的值为“像素点 p(i + 1, j) 的值减去 myVar”。 现在我们可以回答上面的三个问题: 函数 ddx 和 ddy 用于求取相邻像素间某属性的差值; 函数 ddx 和 ddy 的输入参数通常是纹理坐标; 函数 ddx 和 ddy 返回相邻像素键的属性差值; 正是由于 ddx 和 ddy 指令是作用于像素级的,所以 ddx 和 ddy 函数只被片段程序所支持。 当在纹理查询函数中使用 ddx 和 ddy 是可以进行图形过滤。

    2.3K50发布于 2018-09-29
  • 来自专栏沁溪源

    UDP即时通信

    (pDX, IDC_IPLOCAL, IPLocal); DDX_Control(pDX, IDC_PORTLOCAL, PortLocal); DDX_Text(pDX, IDC_PORTLOCAL , LocalPort); DDX_Control(pDX, IDOK, m_Start); DDX_Control(pDX, IDC_STOP, m_Stop); DDX_Control (pDX, IDC_IPDEST, IPDest); DDX_Control(pDX, IDC_PORTDEST, PortDest); DDX_Text(pDX, IDC_PORTDEST , DestPort); DDX_Control(pDX, IDC_EDITWORDS, m_EditWords); DDX_Text(pDX, IDC_EDITWORDS, str ); DDX_Control(pDX, IDC_SEND, m_Send); DDX_Control(pDX, IDC_LIST, list); DDX_Control(pDX

    2.2K20发布于 2020-09-03
  • 来自专栏用户10805953的专栏

    用A*算法让贪吃蛇跑满屏幕(顺手写了个贪吃蛇验证)

    Body_joint> openlist = new PriorityQueue<>(); int[][] oc = new int[height][width]; int[][] ddx for (int i = 0; i < height; i++) { for (int j = 0; j < width; j++) { ddx () + j] + bbtemp.getDis(zd)); openlist.add(bbtemp); ddx = qd.getY()) { bbtemp = new Body_joint(tx - ddx[tx][ty], ty - ddy[tx][ty]); road.addFirst(bbtemp); int tempx=tx; int tempy=ty; tx -= ddx

    60630编辑于 2023-10-26
  • 来自专栏MFC

    MFC/C++学习系列之简单记录8——消息映射

    void CMFCtest1Dlg::DoDataExchange(CDataExchange* pDX){CDialogEx::DoDataExchange(pDX);DDX_Control(pDX, IDC_TAB1, Tab1);DDX_Control(pDX, IDC_BUTTON1, m_Btn1);}DDX_Control 宏用于将对话框中的控件与类中的控件变量进行关联。 这里通过DoDataExchange函数,利用DDX_Control 宏将按钮与成员变量关联。在界面前端,放置控件时,需要添加变量,才能有变量关联操作!

    66800编辑于 2024-11-20
  • 来自专栏气象学家

    推荐|Python绘制3D动态对流层顶(Tropopause)

    [0,:,:]) ddp_f[-1,:,:]=(f[-1,:,:]-f[-2,:,:])/(lev3[-2,:,:]-lev3[-1,:,:]) return(ddp_f) def ddx =(np.roll(f,-1,axis=2)-np.roll(f,1,axis=2))/dx3 ddx_f[:,:,0]=(f[:,:,1]-f[:,:,0])/(x3[:,:,1]-x3[:, :,0]) ddx_f[:,:,-1]=(f[:,:,-2]-f[:,:,-1])/(x3[:,:,-2]-x3[:,:,-1]) return(ddx_f) def ddy(f): =ddx(theta) ddy_theta=ddy(theta) ddx_v=ddx(gaussian_filter(v,sigma=gf)) ddy_ucos=ddy(gaussian_filter( u,sigma=gf)*np.cos(ylat*pi/180)) # calculate contributions to PV and PV absvort=ddx_v-(1/np.cos(ylat

    1.7K30发布于 2020-02-17
  • 来自专栏程序员

    MFC核心架构深度解析

    ,_T("确认"),MB_YESNO|MB_ICONQUESTION)==IDYES){CDialogEx::OnCancel();}}三、DDX(对话框数据交换)机制详解3.1DDX的核心原理DDX机制通过 );DDX_CBString(pDX,IDC_COMBO_STATUS,m_strStatus);//列表框交换DDX_LBIndex(pDX,IDC_LIST_ITEMS,m_nSelectedItem );//控件对象交换DDX_Control(pDX,IDC_COMBO_GENDER,m_cboGender);}3.2DDX宏的编译时展开编译器会将DDX宏展开为具体的代码,以下是对DDX_Text宏展开的模拟 (pDX,IDC_EDIT_NAME,m_strName);DDX_Text(pDX,IDC_EDIT_AGE,m_nAge);DDX_Text(pDX,IDC_EDIT_PHONE,m_strPhone =NULL){pPreview->UpdatePreview(m_nValue,m_strText);}}九、常见问题与调试技巧9.1DDX/DDV常见问题排查展开代码语言:C++AI代码解释//调试DDX

    33110编辑于 2025-12-08
  • 来自专栏全栈程序员必看

    MFC应用程序——标签控件_IP控件_时间控件_List Control控件_Tree Control控件_命令按钮_列表框_组合框_图片_滚动控件「建议收藏」

    IDD = IDD_ABOUTBOX }; #endif protected: virtual void DoDataExchange(CDataExchange* pDX); // DDX (pDX, IDC_LIST1, m_campanyList); DDX_Control(pDX, IDC_COMBO1, m_levelCombox); DDX_Text(pDX, IDC_EDIT1 (pDX, IDC_LIST_school, m_school); DDX_Text(pDX, IDC_EDIT2, m_strName); DDX_Radio(pDX, IDC_RADIO1, m_radio ); DDX_Control(pDX, IDC_LIST2, m_addelems); DDX_Control(pDX, IDC_TREE1, m_treeSchool); // DDX_Control (pDX, IDC_MONTHCALENDAR1, m_canluner); DDX_Control(pDX, IDC_DATETIMEPICKER1, m_startTime); DDX_Control

    3.4K10编辑于 2022-09-23
  • AbMole小讲堂丨Camptothecin(喜树碱):从探索DNA损伤的工具化合物,到抗肿瘤与抗病毒研究

    研究发现BCR-ABL通过激活STAT5信号通路诱导RNA解旋酶DDX5表达,DDX5进一步上调抗凋亡蛋白BIRC5(survivin),以促进CML细胞增殖和存活。 而FL118可以通过抑制拓扑异构酶I和通过泛素-蛋白酶体途径降解DDX5,减少BIRC5表达并激活caspase-3,诱导细胞凋亡。最终克服了CML对Imatinib的耐受性。 FL118 inhibits the activity of Topo I and suppresses the expression of DDX5[31]

    24610编辑于 2025-11-20
  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    【Cell】R-Loop 从生理到病理(二)

    这些包括人类的SETX和FANCM及其酵母同源物Sen1和Mph1,AQR,DDX19,酵母Pif1,DDX23,DDX1,Dbp2(人DDX5),Sgs1(人BLM)等(Chang等人,2017; Cristini DDX19是一个能够在体外解旋DNA-RNA杂交体的核孔相关mRNA导出因子。 基于观察到缺乏DDX19的增殖细胞显示出R环和DSBs的增加,人们提出DDX19作用于复制应激或DNA损伤时形成的R环(Hodroj等人,2017)。 就像其他一些例子,比如Pif1,BLM和Sgs1,DDX9,或FANCM,也显示出了体外DNA-RNA解旋活性。其他解旋酶,如RECQL5,似乎的作用方式不同。 然而,最近还显示出FANCD2与RNA处理因子(包括DEAD-box RNA解旋酶DDX47)相互作用,这可能促进R环的移除 (Okamoto等人,2019)。

    78711编辑于 2023-08-29
  • 来自专栏全栈程序员必看

    简单的TCP客户端发包工具[通俗易懂]

    对话框数据 enum { IDD = IDD_ABOUTBOX }; protected: virtual void DoDataExchange(CDataExchange* pDX); // DDX (pDX, IDC_IPADDRESS1, m_DestIP); DDX_Text(pDX, IDC_EDIT_PORT, m_DestPort); DDX_Text(pDX, IDC_EDIT_CONTENT , m_strContent); DDX_Control(pDX, IDC_STATIC_BCONNECT, m_Tip); DDX_Text(pDX, IDC_STATIC_BCONNECT, m_Status ); DDX_Text(pDX, IDC_EDIT_RESULT, m_Detail); DDX_Control(pDX, IDC_EDIT_RESULT, m_EditResult); DDX_Control (pDX, IDC_EDIT_FAIL, m_EditFail); DDX_Control(pDX, IDC_COMBO1, m_ComboBox); } BEGIN_MESSAGE_MAP(CTCPClientDlg

    4.3K10编辑于 2022-10-04
  • 来自专栏包子的书架

    MFC的自定义控件步骤

    控件与对话框数据交换 在CMyTestDlg.h中定义一个变量: CMyControl m_control; 在对话框类的CMyTestDlg.cpp的DoDataExchange函数中添加 DDX_Control void CMyTestDlg::DoDataExchange(CDataExchange* pDX) { CDialogEx::DoDataExchange(pDX); DDX_Control

    3.5K30发布于 2020-06-17
  • 来自专栏生信修炼手册

    GFF文件格式简介

    ID=gene0;Dbxref=GeneID:100287102,HGNC:HGNC:37102;Name=DDX11L1;description=DEAD/H-box helicase 11 like 1;gbkey=Gene;gene=DDX11L1;gene_biotype=transcribed_pseudogene;pseudo=true NC_000001.11 BestRefSeq ID=id1;Parent=rna0;Dbxref=GeneID:100287102,Genbank:NR_046018.2,HGNC:HGNC:37102;gbkey=misc_RNA;gene=DDX11L1 ID=id2;Parent=rna0;Dbxref=GeneID:100287102,Genbank:NR_046018.2,HGNC:HGNC:37102;gbkey=misc_RNA;gene=DDX11L1 ID=id3;Parent=rna0;Dbxref=GeneID:100287102,Genbank:NR_046018.2,HGNC:HGNC:37102;gbkey=misc_RNA;gene=DDX11L1

    9.6K51发布于 2020-05-08
  • 来自专栏全栈程序员必看

    HLSL 与 GLSL 之间的映射关系参考[通俗易懂]

    各种函数 HLSL GLSL atan2(y,x) atan 使用参数交换 ddx dFdx ddx_coarse dFdxCoarse ddx_fine dFdxFine ddy dFdy ddy_coarse

    2.4K30编辑于 2022-09-14
  • 来自专栏全栈程序员必看

    window 下蓝牙开发[通俗易懂]

    TRUE; } void CBlueToothTestDlg::DoDataExchange(CDataExchange* pDX) { CDialog::DoDataExchange(pDX); DDX_Control (pDX, IDC_EDIT_SHOW, m_editShow); DDX_Control(pDX, IDC_EDIT_INPUT, m_editInput); DDX_Control(pDX, IDC_BUTTON_SEND , m_btnSend); DDX_Control(pDX, IDC_BTN_OPEN, m_btnOpen); DDX_Control(pDX, IDC_BTN_CLOSE, m_btnClose); DDX_Control(pDX, IDC_CHECK_REPEATSEND, m_CheckRepeat); } BEGIN_MESSAGE_MAP(CBlueToothTestDlg, CDialog

    1.4K20编辑于 2022-11-17
  • 来自专栏转载gongluck的CSDN博客

    MFC自定义控件

           在CustomCtrDlg.h中定义一个变量:        CMyTest    m_draw;        在对话框类的CustomCtrDlg.cpp的DoDataExchange函数中添加DDX_Control CCustomCtrDlg::DoDataExchange(CDataExchange* pDX) { CDialogEx::DoDataExchange(pDX); DDX_Control

    2.3K70发布于 2018-03-08
  • 来自专栏生信技能树

    转录组测序数据的高级分析,比如可变剪切,融合基因,lncRNA组装

    -202|DDX11L1|1657|processed_transcript| 1657 1587.157 0.000000 0.000 ENST00000450305.2|ENSG00000223972.5 |OTTHUMG00000000961.2|OTTHUMT00000002844.2|DDX11L1-201|DDX11L1|632|transcribed_unprocessed_pseudogene .transcripts.fa 内容如下 >ENST00000450305.2|ENSG00000223972.5|OTTHUMG00000000961.2|OTTHUMT00000002844.2|DDX11L1 -201|DDX11L1|632|transcribed_unprocessed_pseudogene| # gencode.v37.annotation.gtf 内容如下 chr1 HAVANA gene_id "ENSG00000223972.5"; gene_type "transcribed_unprocessed_pseudogene"; gene_name "DDX11L1"; level

    2.9K20发布于 2021-10-21
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