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  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言线性趋势检验:Cochran Armitage 检验

    使用DescTools包中的CochranArmitageTest()函数进行检验: DescTools::CochranArmitageTest(df) ## ## Cochran-Armitage

    1.7K20编辑于 2023-02-14
  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言有序logistic回归-因变量为等级资料

    Chi-squared test ## ## data: df$Y and pred ## X-squared = 14.246, df = 2, p-value = 0.0008065 计算伪R2: DescTools

    2.3K30编辑于 2022-11-15
  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言卡方检验方法总结

    课本还介绍了Breslow-Day对各层的效应值进行齐性检验,这个检验可以通过DescTools包实现: library(DescTools) ## Registered S3 method overwritten by 'DescTools': ## method from ## reorder.factor gdata BreslowDayTest(myo) ## ## Breslow-Day

    4.4K30编辑于 2022-11-15
  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类

    Chi-squared test ## ## data: df$Y and pred ## X-squared = 39.521, df = 4, p-value = 5.436e-08 计算伪R^2: DescTools

    1.3K30编辑于 2022-11-15
  • 来自专栏小明的数据分析笔记本

    使用StainedGlass的输出结果用R语言自己画三角形热图展示着丝粒的位置

    (老俊俊的生信笔记)这里用到了一个函数getRotatedPolygon 把原始数据进行转换(这里转换的逻辑我暂时还没想明白),这个函数来源于R包BioSeqUtils,我安装这个R包的时候遇到报错,DescTools

    1.1K21编辑于 2024-03-04
  • 来自专栏医学和生信笔记

    多变量数据的统计描述和统计推断(hotelling-T检验、多元方差分析、轮廓分析)

    除了ICSNP外,还可以使用DescTools::HotellingsT2Test实现,但是该函数完全来自于ICSNP包,基本完全一样,所以不再介绍,还有一个rrcov包也可以实现hotelling-T2 也可以使用DescTools或者rrcov实现,完全一样的用法(注意函数的名字略有不同),结果也完全一样,这里就不再重复了。

    19710编辑于 2026-03-17
  • 来自专栏TechBlog

    R语言之 ggplot 2 和其他图形

    DescTools 包里的 PlotPyramid( ) 函数,以及 epiDisplay 包里的 pyramid( )函数都可以用来绘制金字塔图。

    1.9K20编辑于 2023-10-13
  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言logistic回归的细节解读

    0.466253375 0.655579178 # 偏差 deviance(f) ## [1] 40.02758 # 残差自由度 df.residual(f) ## [1] 42 # 伪R^2 DescTools

    1.4K40编辑于 2022-11-15
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