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三代测序 - 数据质控 | fastplong
#下载最新版本$ wget http://opengene.org/fastplong/fastplong$ chmod a+x . /fastplong/fastplong.0.2.2$ mv fastplong.0.2.2 fastplong #修改软件名称$ chmod a+x . 默认情况下，HTML 报告会保存为 fastplong.html（可以通过 -h 选项指定），JSON 报告会保存为fastplong.json（可以通过 -j 选项指定）$ fastplong -i 建立2_fastplong文件夹，fastplong的结果文件放在2_fastplong下。参数根据质控结果和实际情况进行调整就行。 $ fastplong -i 1_raw_fastq/sample.fastq.gz -o 2_fastplong/sample..fastq.gz \ -h 2_fastplong/sample.report.html
1.5K23编辑于 2025-02-24 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（5）：PacBio数据分析如何挑选最佳质控工具？
fastplong：长读长时代的“神器”新星 “如果你用过二代数据质控的经典神器fastp，那么fastplong你完全可以‘闭眼入坑’了！”李博士强烈推荐道。 功能全面： fastplong不仅能提供详尽的数据统计报告，还具备对序列进行过滤和修剪的功能，帮助用户去除低质量或短小的reads，为后续分析“净化”数据。 因此，李博士建议，在进行任何下游分析之前，首先运行一下fastplong，对PacBio数据进行初步的质量评估和预处理，这将为后续的分析奠定坚实的基础。
63110编辑于 2025-06-08 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（6）：ONT数据分析如何挑选最佳质控工具？
fastplong：长读长通用质控新星 在上一期我们推荐过、由开发二代数据质控神器fastp的OpenGene团队推出的fastplong工具，同样适用于纳米孔测序数据。 “对于追求高效便捷的老师和同学们，fastplong绝对是值得信赖的‘一站式解决方案’。”李博士表示。
63000编辑于 2025-06-13 - 来自专栏天意生信俱乐部
CycloneSEQ-WT02测评系列（三）：从原始数据到高质量细菌基因组组装
Fastplong过滤：去除平均碱基质量<10、长度<1000bp的reads，确保后续组装的高质量输入。 Canu组装：利用长读长优势进行基因组组装，生成初始contigs。
56610编辑于 2025-05-22 - 来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（18）：纳米孔直接RNA测序分析流程（上）——从原始信号到高质量序列
当然，正如我们之前介绍过的fastp的“长读长兄弟”——fastplong，也可以在这里一步完成质量评估和过滤，为追求效率的研究者提供了便利。
50510编辑于 2025-11-20 - 来自专栏三代测序-说
三代测序 - 数据质控 | Bamboo
对于三代纳米孔测序平台，查看数据统计信息和质量最常用的就针对牛津纳米孔（ONT）数据开发的Nanopack分析套装，如NanoPlot，NanoComp和NanoQC，以及老牌质控软件fastp针对三代长度长数据优化的fastplong
1.1K12编辑于 2025-05-21
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