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跟着Nature学作图：R语言ggridges包绘制山脊图
randomcoloR) palette <- distinctColorPalette(10) 这里randomcoloR这个R包是第一次使用，主要作用是生成比较容易区分的颜色 作图 library(ggridges
2.2K20编辑于 2022-05-23 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
Python-joypy和 R-ggridges 峰峦图制作
R-ggridges 绘制 借助于R语言丰富且强大的第三方绘图包，在应对不同类型图表时，机会都会有对应的包进行绘制。 本次就使用ggridges包（https://wilkelab.org/ggridges/）进行峰峦图的绘制。 labs(title = "Ridgeline plots of media shares (TV, Online News and Google Trends)", subtitle = "ggridges
1.6K10发布于 2021-02-22 - 来自专栏生信宝典
R语言可视化学习笔记之ggridges包
简介 ggridges包主要用来绘制山峦图。尤其是针对时间或者空间分布可视化具有十分好的效果。 ggridges主要提供两个几何图像函数： geom_ridgeline(): 主要绘制山脊线图 geom_density_ridges()：主要绘制密度山脊线图 具体用法可以参考官方文档（https: //cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/introduction.html） geom_ridgeline() library(ggridges cyclinal scales 为了使得ggridges绘制的图形可视化效果最好，同时为了减少用户对颜色设置的困难，作者提供了cyclinal scales用于颜色轮转映射。 ://cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/gallery.html）继续学习。
2.6K40发布于 2018-12-06 - 来自专栏生信宝典
R语言可视化学习笔记之ggridges包绘制山峦图
简介 ggridges包主要用来绘制山峦图。尤其是针对时间或者空间分布可视化具有十分好的效果。 ggridges主要提供两个几何图像函数： geom_ridgeline(): 主要绘制山脊线图 geom_density_ridges()：主要绘制密度山脊线图 具体用法可以参考官方文档： https ://cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/introduction.html geom_ridgeline() library(ggridges cyclinal scales 为了使得ggridges绘制的图形可视化效果最好，同时为了减少用户对颜色设置的困难，作者提供了cyclinal scales用于颜色轮转映射。 //cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/gallery.html）继续学习。
2.8K40发布于 2020-09-27 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
可视化绘制 | R-ggridges包峰峦图绘制
本节主要使用ggridges包[1]中的geom_density_ridges()进行绘制峰峦图。详细介绍如下： 1.数据结构 这里使用base包中的diamonds数据集做例子。 可以使用ggridges提供的特殊比例来设置抖动点的样式。scale_discrete_manual()可用于制作具有任意形状和比例的图形。 对于该包的其他有趣函数与可视化可参考以下资料： Introduction to ggridges[2] RDocumentation-ggridges[3] Basic ridgeline plot[4 ] 参考资料 [1] ggridges包: https://wilkelab.org/ggridges/index.html [2] Introduction to ggridges: https:// cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes/introduction.html [3] RDocumentation-ggridges: https
2.2K10发布于 2021-02-22 - 来自专栏R语言学习
多系列数据核密度图
ggridges包提供了geom_density_ridges_gradient()函数，用于画核密度估计峰峦图 1数据结构 这里我们用到的是ggridges内了数据lincoln_weather，该数据是关于每个月各种天气指标 这是我简化后的数据，便于展示 与单数据系列不同的是这里要提供两个变量，x轴对应温度，即统计变量，y轴为分类变量 image.png 2绘制峰峦图代码 library(ggplot2) library(ggridges stat_density_ridfes()画峰峦图，其实它是geom_density_ridges_gradient所要调用的函数，这里可以用stat参数 library(ggplot2) library(ggridges 0.025]", "(0.025, 0.975]", "(0.975, 1]") ) image.png 5用stat中计算的累积概率值填色 library(ggplot2) library(ggridges name = "Probability", direction=-1) image.png 6jittered_point绘制带点的概率分布图 library(ggplot2) library(ggridges
2.4K00发布于 2020-09-26 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
绘制混合密度函数图以及添加分位数线
简介 最近有个需求，统计课中需要绘制以下图形： 这里我主要使用 ggridges 包中的 stat_density_ridges()。 这个包的介绍，小编以前做过一期内容，可见：ggridges包—峰峦图详细介绍。读者需要进一步阅读课件这篇博文[1]，以及一些案例[2]。 加载包 library(ggplot2) library(ggridges) 产生数据集 假设数据来源于一个混合分布。
74410编辑于 2022-04-08 - 来自专栏数据小魔方
Excel-R-Python: 峰峦图的实现
其中关于R-ggridges包的问题1今天有了新的认识，并做修正奉献给大家。 ggridges包有一个很惊艳的函数geom_density_ridges_gradient（）可以绘制多数据系列的核密度估计图，如下图所示： 在这个函数中，fill的颜色还可以以x轴的数值作为映射，
2.1K10发布于 2020-03-30 - 来自专栏生信菜鸟团
R tips：空间最近邻分析
dplyr::filter(center =="Cell_A")%>% ggplot(aes(x = distance, y =Group, fill = after_stat(x)))+ ggridges ::geom_density_ridges_gradient()+ facet_wrap(~ others)+ ggridges::theme_ridges()+ scale_x_log10 dplyr::filter(center =="Cell_A")%>% ggplot(aes(x = distance, y = others, fill = after_stat(x)))+ ggridges ::geom_density_ridges_gradient()+ facet_wrap(~Group)+ ggridges::theme_ridges()+ scale_x_log10()
37910编辑于 2025-05-12 - 来自专栏生信宝典
12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化
5 ggridges 作者：Claus O. Wilke 网址：https://www.rdocumentation.org/packages/ggridges 简介：ggridges包主要用来绘制山峦图。 R语言可视化学习笔记之ggridges包 利用ComplexHeatmap绘制热图(一) ggplot2学习笔记之图形排列 R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换 不写代码，用下高颜值在线绘图
3.6K21发布于 2018-12-25 - 来自专栏数据分析1480
12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化
5 ggridges 作者：Claus O. Wilke 网址：https://www.rdocumentation.org/packages/ggridges 简介：ggridges包主要用来绘制山峦图。
1.9K11发布于 2019-07-15 - 来自专栏技术博客文章
ggplot2 图层
scale_fill_manual(values = wes_palette("Darjeeling2")) 山岭图：geom_density_ridges() # 安装 # install.packages("ggridges ") library(ggridges) ggplot(blockbusters, aes(x = box_office, y = genre, fill = genre)) + geom_density_ridges
1K10编辑于 2021-12-06 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
整理了一些自己可能会用到的R包
Office and Import Figures and Tables 整个包好像有一个函数可以抽取pdf文件的配色，比如某篇论文的图片配色非常喜欢，可以直接提取并且用到自己想画的图中——infigure ggridges Geoms to make ridgeline plots with ggplot2 山脊图 介绍https://cran.r-project.org/web/packages/ggridges/vignettes
2.2K20发布于 2020-09-22 - 来自专栏生信技能树
创造示例数据并且同步讲解绘图技巧的资源推荐
最重要的是每个图都配有示例数据和代码 比如：http://www.r-graph-gallery.com/294-basic-ridgeline-plot.html 出图如下： 配套代码是： # library library(ggridges
51320发布于 2021-09-17 - 来自专栏单细胞天地
R可视化之美化山脊图
(list=ls()) library(Seurat) library(purrr) library(dplyr) library(ggplot2) library(cowplot) library(ggridges
4.5K10编辑于 2022-03-14 - 来自专栏简说基因
更强的可视化：最全ggplot2扩展包整理
ggalluvial:绘制流程图和分层桑基图 ggridges:绘制密度图和堆叠图，用于展示数据在一个连续变量上的分布。 ggside:用于创建分面图（faceted plots）的扩展包。
1.3K10编辑于 2024-12-23 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞韧皮部研究代码解析1-QC_filtering.R
R包的加载library(data.table)library(scater)library(scran)library(ggplot2)library(ggpointdensity)library(ggridges removing low-UMI clusters# Total UMI distributionsggplot(colData(ring_soft), aes(total, Sample)) + ggridges x = "Total UMIs", y = "")# detected genesggplot(colData(ring_soft), aes(detected, Sample)) + ggridges
86500编辑于 2023-04-02 - 来自专栏深度学习|机器学习|歌声合成|语音合成
R语言实战：心血管病分析实例
install.packages('car') # install.packages('ggplot2') # install.packages('survminer') # install.packages('ggridges library(ggplot2) library(glmnet) library(MASS) library(survival) library(rms) library(survminer) library(ggridges
1K30发布于 2021-01-14 - 来自专栏生信技能树
在Ubuntu下安装旧版seurat
RColorBrewer", "irlba", "reshape2", "gplots", "dtw", "SDMTools", "plotly", "Hmisc", "httr", "tidyr", "ggridges
2.5K10发布于 2019-07-30 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
可视化中你最常用的软件包有哪些？
ggvis包---数据可视化交互 ggridges包---峰峦图详细介绍 esquisse包---不写代码生成ggplot图 calendR包---私人定制专属日历 corrplot包：相关性矩阵可视化
1.6K40发布于 2021-04-09
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