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  • 来自专栏医学和生信笔记

    超强的gtSummary ≈ gt + comparegroups ??

    gtsummary包是专门用来画表格的,高度自定义的多种选项,快速绘制发表级表格。可用于总结汇总数据集、多种模型等。 快速绘制描述性统计表格、基线资料表(例如医学期刊常见的表1!) 。 本期目录: 安装 tbl_summary 基本使用 自定义输出 修改统计方法 同一个变量展示多个统计量 交叉表 和compareGroups包进行比较 安装 # 2选1 install.packages("gtsummary ") remotes::install_github("ddsjoberg/gtsummary") tbl_summary 自动计算描述性统计指标,支持连续型变量、分类变量,生成的表格支持自定义细节 library(gtsummary) suppressPackageStartupMessages(library(tidyverse)) 使用自带的trial数据集进行演示,这个数据集也是临床中常见的数据类型 ## [7] tidyr_1.2.0 tibble_3.1.7 ggplot2_3.3.6 ## [10] tidyverse_1.3.1 gtsummary

    2.4K80编辑于 2022-11-15
  • 来自专栏优雅R

    「R」gtsummary 用表格玩转数据汇总

    gtsummary 是一个基于 gt 包的数据汇总表生成包。 ("gtsummary") 开发版: remotes::install_github("ddsjoberg/gtsummary") 使用 数据框 跟它的依赖包 gt 很类似。 更多的介绍和使用请看英文文档:http://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/[2] 参考资料 [1]https://github.com/ddsjoberg/gtsummary : https://github.com/ddsjoberg/gtsummary [2]http://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/: http://www.danieldsjoberg.com /gtsummary/

    2.3K30发布于 2020-07-03
  • 来自专栏生信补给站

    gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总表“神器”

    晚上想起上午时候提示我没有tbl_summary函数,查到是gtsummary包的,习惯性看了下包的功能,这不是也可以绘制三线表? 惊了,于是有了这篇分享。 1 下载R包,数据 使用内置数据集演示 #install.packages("gtsummary") library(gtsummary) #查看内置数据集 head(trial) ? 四 参考资料: http://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/ http://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/articles/gallery.html

    2.7K30发布于 2021-01-18
  • 数据分析:宏基因组数据的荟萃分析

    curatedMetagenomicData)library(tidyverse)library(SummarizedExperiment)library(TreeSummarizedExperiment)library(gtsummary study_name %in% datasets_tokeep$study_name)​metadata %>% dplyr::select(study_name, age, gender, BMI) %>% gtsummary ::tbl_summary(by = "study_name") %>% gtsummary::modify_header(label ~ "**Characteristic**") %>% gtsummary ::add_p() %>% gtsummary::add_overall() %>% gtsummary::bold_labels() 添加图片注释,不超过 140 字(可选)肠道微生物数据通过curatedMetagenomicData

    89210编辑于 2024-08-15
  • 来自专栏优雅R

    生信爱好者周刊(第 28 期):华大Stereo-seq系列成果揭秘超高分辨率生命全景时空图谱

    4、gtreg - Regulatory Tables For Clinical Research with 'gtsummary'[7] library(gtreg) gtsummary::theme_gtsummary_compact processor: https://github.com/pdfcpu/pdfcpu [7] gtreg - Regulatory Tables For Clinical Research with 'gtsummary

    1.6K10编辑于 2022-06-27
  • 来自专栏优雅R

    生信爱好者周刊(第 2 期):生信的境界与道路

    主题 数据高亮 5、gtsummary[16] - 准备好的演示数据总结和分析结果表 gtsummary包提供了一种优雅而灵活的方法来使用R编程语言创建可发布的分析和汇总表。 gtsummary包总结了数据集、回归模型等等,使用了具有高度可定制功能的合理默认值。 6、mathpix[17] - 图片转公式神器 好用的公式提取工具。支持拷贝到Word和LaTex。 eulerr [14] gt: https://gt.rstudio.com/ [15] gtExtras: https://github.com/jthomasmock/gtExtras [16] gtsummary : https://github.com/ddsjoberg/gtsummary [17] mathpix: https://mathpix.com/ [18] Cookbook for R 中文版:

    1.8K20发布于 2021-09-24
  • 来自专栏优雅R

    「R」表格可视化 10+ 指南【前篇】

    `gtsummary`[7] - 有用的 gt 拓展包。 以下是表格语法: ? reactable: https://glin.github.io/reactable/ [6] flextable: https://davidgohel.github.io/flextable/ [7] gtsummary : http://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/ [8] 文档: https://gt.rstudio.com/reference/tab_options.html

    1.8K20发布于 2020-10-28
  • 手把手教你R语言复现mindfulness_PTSS_COVID19文献结果

    xfun::session_info(packages = c( "tidyverse", "readxl", "gtsummary", "stringr", "writexl", "psych" en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8 / C / en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8#> #> Package version:#> DT_0.33 gtsummary

    36210编辑于 2024-06-11
  • 来自专栏R语言数据分析指南

    bstfunb: 各种生物统计函数汇总

    ❞ 加载R包 library(tidyverse) devtools::install_github("MSKCC-Epi-Bio/bstfun") library(bstfun) library(gtsummary

    46320编辑于 2023-08-18
  • R语言生存分析和科研绘图

    T > t)$是累积分布函数生存分析应用案例加载R包导入本教程分析所需要的R包library(tidyverse)library(survival)library(survminer)library(gtsummary

    46400编辑于 2024-06-12
  • 来自专栏优雅R

    生信爱好者周刊(第 50 期):顶级1区期刊宣布:明年起将不再拒稿!

    链接:https://cran.r-project.org/web/packages/gridExtra/vignettes/tableGrob.html 11.gtsummary | 批量建模并输出整洁模型结果 本推文通过具体示例介绍了利用gtsummary包进行快速回归建模并输出统计结果的方法。

    1.2K10编辑于 2022-12-30
  • 来自专栏生信补给站

    funkyheatmap |临床+组学+分组数据可视化“神器”,时髦的热图

    临床数据一般是使用图表汇总Table1的方式进行展示,例如R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表 或者 gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总表“神器” 。

    1.7K20编辑于 2023-03-08
  • 来自专栏数据 学术 商业 新闻

    听说你还不会画表格?!我给你汇总好了全部方法~~

    :tab_model(CSS=**) 更多其他案例大家可参考:R-sjPlot回归表格绘制[3] 当然,除了上面介绍的外,下面小编再汇总列出其他的优秀第三方R包,小伙伴们可自行选择学习哈~如下: R-gtsummary

    1.5K30编辑于 2022-10-25
  • 来自专栏数据 学术 商业 新闻

    全了!!表格可视化制作技巧大汇总~~

    :tab_model(CSS=**) 更多其他案例大家可参考:R-sjPlot回归表格绘制[3] 当然,除了上面介绍的外,下面小编再汇总列出其他的优秀第三方R包,小伙伴们可自行选择学习哈~如下: R-gtsummary

    2K60发布于 2021-08-25
  • 来自专栏医学和生信笔记

    R语言倾向性评分:匹配

    傻傻分不清楚 超强的gtSummary ≈ gt + comparegroups ?? 等,为什么用tableone呢?

    3.8K41编辑于 2023-02-14
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