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  • 文献分享(visium)--空间转录组学的泛癌分析揭示异质性肿瘤空间微环境

    定义局部细胞程序(LCP):为了刻画TSME,对恶性区和基质区内的细胞组成分别进行无监督聚类,识别出:28个恶性局部细胞程序(MLCP)28个基质局部细胞程序(SLCP)这些LCP的丰度在不同癌症类型间差异很大 例如,MLCP_Tumor(肿瘤细胞主导的程序)在皮肤鳞状细胞癌中比例高,在肾癌中比例低。解析LCP的空间分布:自身聚集性:MLCP_Tumor的自我连接度最高,反映了肿瘤细胞的局部聚集。 这些生态位可大致分为两类:生态位1-6:主要由恶性局部细胞程序(MLCP) 构成。Niche_1:主要由肿瘤细胞组成,代表肿瘤细胞聚集、其他TME细胞浸润较少的区域。 Niche_12:包含浆细胞的MLCP和SLCP。Niche_13:聚集了B细胞、常规树突状细胞(cDC)、CD4+ T和CD8+ T细胞,类似于三级淋巴样结构(TLS)的生态位。

    21420编辑于 2026-05-21
  • 来自专栏用户10781703的专栏

    2023 NCTF writeup

    [x] MBruteforcing: Trying "kNTk","kkKT","jRCs","kiFT" -- 16.391% [x] MBruteforcing: Trying "mOLg","mlCP

    1.8K20编辑于 2023-12-27
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