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榕树集-蛋白质表面指纹（MaSIF）
然后使用pymesh将蛋白质网格下采样和规则化到1.0Å的分辨率（优化MESH）。在蛋白质网格上直接计算几何和化学特征。
1.3K30编辑于 2023-05-24 - 来自专栏DrugOne
Nat. Methods | 基于几何深度学习解密蛋白分子表面的相互作用指纹
Python (2.7) reduce (3.23)：蛋白质添加质子 MSMS (2.6.1)：计算蛋白质表面 BioPython (1.66)：解析PDB文件 PyMesh (0.1.14)：处理层曲面
1.9K51发布于 2021-02-02
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