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利用基因家族基因构建预后模型发6分+SCI
结果表明，RGS4、RGS18、RGS9、RGS19、RGS13、RGS12、RGS10、RGS1、RGS16基因的表达与基质评分呈显著正相关。 RGS10、RGS19、RGS13、RGS1、RGS2、RGS18基因的表达水平与免疫评分呈正相关。 3. RGS5, RGS3和 RGS16在卵巢癌样本中显著高表达，而RGS7, RGS9, RGS12, RGS17, RGS2和 RGS8显著低表达。 图2 卵巢癌和正常组织中RGS基因家族表达水平 KM分析表明，RGS8, RGS4, RGS2, RGS19和RGS11低表达的患者OS较长（图3a），RGS8, RGS5, RGS2, RGS19, RGS11、RGS14、RGS10、RGS19、RGS20、RGS13、RGS1、RGS21、RGS18、RGS4、RGS5、RGS3、RGS16的突变频率分别为2.4%、2.8%、1.6%、10%、7%
1.2K40发布于 2021-07-12 - 来自专栏纳米药物前沿
中山大学宋尔卫苏士成Nature Immunology：抑制RGS1可增强肿瘤特异性T细胞在乳腺癌中的浸润
研究人员发现，辅助TH1细胞和细胞毒性T淋巴细胞（CTL）中RGS1（regulator of G protein signaling 1）的上调减少了它们向肿瘤的运输和存活，并且与乳腺癌和肺癌患者的存活期缩短有关 RGS1被II型干扰素（IFN）-STAT1（signal transducer and activator of transcription 1）信号上调，并通过抑制钙内流以及抑制激酶ERK和AKT的激活来削弱循环 过继转移的肿瘤特异性CTL中的RGS1敲低显著增加了它们在乳腺癌和肺癌移植物中的浸润和存活，并有效地抑制了体内肿瘤生长，当与程序性死亡配体1(PD-L1)检查点抑制策略相结合时，这一点得到进一步改善。 本文研究结果表明RGS1对肿瘤免疫逃逸十分重要，并表明靶向RGS1可能为肿瘤免疫治疗提供新的策略。 参考文献： Di Huang, et al.
85510编辑于 2022-08-15 - 来自专栏单细胞天地
你认为是双细胞人家说是全新细胞亚群
pheatmap(cor(av[cg,])) 可以看到基质细胞里面的 fibroblast 细分4个亚群（STF1~STF4），如下所示：： pericytes (STF2; defined by RGS5 也就是说 发现了新的细胞类型STF4，这个新的单细胞亚群居然是同时表达内皮细胞(PLVAP)和周细胞(RGS5)相关标记，当然了，数量并不多，近40个10X样品里面居然就821个这样的细胞： 原文是这样描述的 of all cells, n = 821), expressing markers associated with both endothelial (PLVAP) and fibroblast (RGS5 such as doublet effects (30), 而且实验验证了这个全新细胞亚群：and orthogonally validated the existence of the PLVAP/RGS5
85730编辑于 2021-12-27 - 来自专栏生信技能树
细分特定单细胞亚群的时候混入了其它亚群的解决方案
得到的基质细胞里面的 fibroblast 细分4个亚群（STF1~STF4），如下所示：： pericytes (STF2; defined by RGS5 and NOTCH3), fibroblasts 也就是说 发现了新的细胞类型STF4，这个新的单细胞亚群居然是同时表达内皮细胞(PLVAP)和周细胞(RGS5)相关标记，当然了，数量并不多，近40个10X样品里面居然就821个这样的细胞。 such as doublet effects (30), 然后实验验证了这个全新细胞亚群：and orthogonally validated the existence of the PLVAP/RGS5 expressing DCN, GSN and COL1A2), 6565 ECs (expressing VWF and CD36), 975 pericytes (PCs) (expressing RGS5
1.7K10编辑于 2023-09-04 - 来自专栏生命科学
免疫检查点 "新星"：HLA-E-MedChemExpress
■ 机制探究CTC 通过参与血小板来源的 RGS18 上调免疫检查点分子 HLA-E那么 CTCs 是如何动员 HLA-E 的呢？研究人员评估了可能与 HLA-E 表达水平呈正相关的差异表达基因。 观察到 RGS18 并非在原发和转移病灶的肿瘤细胞中表达，而是几乎只在 CTC 中表达。众所周知，CTC 通常被血小板覆盖，而血小板是 RGS18 蛋白的主要来源[6]。 机制研究表明，血小板源性 RGS18 通过 AKT-GSK3b-CREB 信号通路促进 HLA-E 的表达，RGS18 过表达促进胰腺肿瘤肝转移 (图 4)。 机制探讨：1.当向血管内灌注 CTC 时，CTC 会粘附并摄取携带 RGS18 的血小板。 2.RGS18 抑制宿主细胞中 p-AKT 的活化，进而抑制 GSK3β Ser9 的磷酸化而稳定 GSK3β 蛋白。
43120编辑于 2023-04-06 - 来自专栏单细胞天地
单细胞数据揭示两种巨噬细胞亚型及其预测胃腺癌免疫治疗和预后的相关预后因素
将WGCNA分析中获得的巨噬细胞亚群（670）和巨噬细胞模块基因（2,360）中特异性表达的基因取交集，在86个常见基因中，鉴定出7个预后因子（RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、 RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、NRP1和PDE4A是STAD的预后指标，其中GNAI2和PDE4A是保护指标，RGS2、ANXA5、MARCKS、CD36和NRP1是危险指标 首先，在HPA数据库中查询RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、NRP1和PDE4A的蛋白产物表达水平。MARCKS基因编码的蛋白质在STAD组织中的表达低于正常胃组织（图4A）。 STAD组织中RGS2、PDE4A和CD36的mRNA水平升高，正常组织中GNAI2、MARCKS和NRP1的mRNA水平升高（图4B）。7个预后因素的表达也具有组织特异性。 RGS2在胞质溶胶中特异性表达，ANXA5在核膜中特异性表达，CD36在高尔基体中特异性表达（图4C）。此外，发现 GNAI2 的显着拷贝数缺失（图 4D）。
1.1K10编辑于 2024-04-01 - 来自专栏文献分享
Science Advances｜快来学习这篇泛癌成纤维细胞的思路和绘图技巧！
TSPAN8+ chromatin remodeling fibroblast.研究团队确认了CFD+ inflammatory fibroblast, MMP11+ myofibroblast , RGS5 不同成纤维细胞亚型（如SPP1+电子转运、CFD+炎性、KRT14+电子转运成纤维细胞）的衰老评分在年龄组间差异显著，而RGS5+肌成纤维细胞在五种组织中均显示衰老与老化正相关，TSPAN8+染色质重塑成纤维细胞在卵巢和结肠中呈显著负相关 RGS5+ 肌成纤维细胞 - 表达 PDGFRB（PDGFB 的受体），主要与 上皮/内皮细胞 互作，几乎不与免疫细胞互作。 单细胞分析显示，不同成纤维细胞亚型 在肿瘤微环境中分布各异：CFD+ 炎性成纤维细胞 富集于癌旁组织，而 RGS5+ 肌成纤维细胞 和 IL6+ 炎性成纤维细胞 在非缓解肿瘤中增多，TSPAN8+ 成纤维细胞
38701编辑于 2025-04-15 - 来自专栏PPV课数据科学社区
【学习】Vlookup、Lookup都靠边，Mlookup函数来了
代码 Function Mlookup(rg, rgs As Range, L As Integer, M As Integer) Dim arr1, ARR2, 列数 Dim R, n, K, X, cc, sr As String arr1 = rg.Value ARR2 = rgs If VBA.IsArray(arr1) Then For Each R In arr1 If R <> "" Then
2.9K81发布于 2018-04-20 - 来自专栏单细胞天地
单细胞RNA测序探究炎症性癌相关成纤维细胞在膀胱尿路上皮癌中的作用
epithelial (EPCAM+) cells endothelial (CD31+) cells (COL1A1+)—iCAFs (PDGFRA+) myo-CAFs (mCAFs) (RGS5+ 肌动蛋白阳性癌相关成纤维细胞 (RGS5+)：RGS5是一种基因，主要在肌动蛋白阳性癌相关成纤维细胞中表达，这些细胞在肿瘤微环境中起到促进肿瘤生长的作用。
83640编辑于 2023-11-01 - 来自专栏数据库
后GWAS时代的数据整合：RegulomeDB和HaploReg数据库
Fig 4. rs2816305, rs2984920和rs7535818在Regulome的查询结果 rs2816305为RGS1的eQTL，同时处于调控元件内部。 rs2984920在RGS1启动子内部，并且处于 PU.1和NFKB的motif内部（Fig 5）。这两个SNP都值得继续深入研究。 Fig 5.
2.5K120发布于 2018-02-24 - 来自专栏生信技能树
肿瘤相关成纤维单细胞亚群的iCAF和myCAF迷思
(pricytes) ACTA2 (smooth muscle cells) 文章后续继续对成纤维，内皮，周细胞，平滑肌细胞的细分的时候，文章里面的平滑肌细胞的细分里面又一次出现了周细胞，这个时候的RGS5 比如这个 肿瘤相关成纤维细胞异质性 就是分成了6群： Subcluster 0 被作者定义为 vascular CAFs ，高表达 GJA4, and RGS5 等 Subcluster 1 被作者定义为 ofibroblast–c5–FABP1 ，高表达APOA2, FABP1, FABP4, and FRZB等 如果按照其它理论，会认为所谓的 vascular CAFs ，高表达 GJA4, and RGS5
3.8K11编辑于 2023-11-30 - 来自专栏python3
用 ipdb 调试 Python 程序
<python 命令> h (帮助) a(rgs) 打印当前函数的参数 j(ump) 让程序跳转到指定的行数 l(ist) 可以列出当前将要运行的代码块 n(ext)
79820发布于 2020-01-07 - 来自专栏生信技能树
为什么一个基因可以既是lncRNA又是protein_coding
MATR3 2 PDE11A 2 POLR2J3 2 POLR2J4 2 PRICKLE2-AS1 2 RAET1E-AS1 2 RGS5 lncRNA ENSG00000236915 chr1 86571181 86696311 CLCA4-AS1 lncRNA ENSG00000261737 chr1 86703502 86704462 RGS5 protein_coding ENSG00000143248 chr1 163111121 163321791 RGS5-AS1 lncRNA ENSG00000232892 chr1 163161675 163213023 RGS5 lncRNA ENSG00000232995 chr1 163244505 163321894 LINC00486 lncRNA ENSG00000230876 chr2
1.8K52发布于 2021-02-04 - 来自专栏单细胞天地
你确定你研究的是成纤维细胞吗
比如这个 肿瘤相关成纤维细胞异质性 就是分成了6群： Subcluster 0 被作者定义为 vascular CAFs ，高表达 GJA4, and RGS5 等 Subcluster 1 被作者定义为 ofibroblast–c5–FABP1 ，高表达APOA2, FABP1, FABP4, and FRZB等 如果按照其它理论，会认为所谓的 vascular CAFs ，高表达 GJA4, and RGS5
1.1K20编辑于 2022-01-17 - 来自专栏单细胞天地
单细胞RNA测序揭示了小肠神经内分泌癌患者的肝转移特异性靶点
在成纤维细胞簇中，COL1A2的表达似乎相似，但转移性肿瘤成纤维细胞表达的RGS5要多得多， RGS5是一种g蛋白调节剂，仅在周细胞中表达（周细胞类似于血管内皮细胞周围的成纤维细胞） 与原发肿瘤中大量成纤维细胞一致
33210编辑于 2024-02-22 - 来自专栏生信菜鸟团
R：STRINGdb包用于string蛋白互作分析
就不再找其他的基因测试了（比如clusterProfiler里面的geneList基因集） gene <- c('Drd2','Lrrc10b','Adora2a','Gpr6','Syndig1l','Rgs9 Vat1l','Wdr6','Nnat','6330403K07Rik','Sst','Pdyn','Tac1','Strip2', 'Drd1','Wfs1','Ppp1r2','Penk','Rgs9 Synpr','Gm17750','Ampd2', 'Meis2','Ankrd6','Ppm1e','Pbx1','Inpp5j','Grb2','Csdc2','Gprc5b','Nrep','Rgs12 ','Crym','Hs3st4','Prkca','Chgb','Cpne6', 'Dock9','Prkcg','Cpne7','Grin2a','Dkk3','Nt5dc3','Ak5','Rgs14
8.7K13发布于 2020-07-30 - 来自专栏生信菜鸟团
单细胞数据集中常见marker基因汇总_2024版
Cfap126,Fam183b,Tmem212,pifo,Tekt1,Dnah12' pericyte=c( 'DCN', 'LUM', 'GSN' ,'FGF7','MME', 'ACTA2','RGS5 ,"MGP") Fibroblast=c("DCN", "GSN" ,"LUM","FBLN1","COL1A2") SMC=c("ACTA2", "CALD1", "MYH11","Myo1b","RGS5 ','NCR1', # NK 'FGF7','MME', 'ACTA2', ## human fibo 'GJB2', 'RGS5
1.1K11编辑于 2025-03-03 - 来自专栏往期博文
【Android】常用技巧汇总(持续更新)
void onClick(View v) { finish(); } }); 多个按钮监听 Button btn_register = findViewById(R.id.btn_rgs ; startActivity(intent); finish(); break; case R.id.btn_rgs
52510编辑于 2022-06-14 - 来自专栏Reinvent Data Science
不懂就问，Milvus 新上线的资源组功能到底怎么样？
utility.create_resource_group("rg1", using='default') utility.create_resource_group("rg2", using='default') rgs = utility.list_resource_groups(using='default') print(f"Resource group list: {rgs}") # Resource group
50230编辑于 2023-08-26 - 来自专栏单细胞天地
肿瘤相关成纤维细胞异质性
) and were characterized by microvasculature signature genes such as CD146 (MCAM), MYH11, GJA4, and RGS5 很完美的生物学解释，： Subcluster 0 被作者定义为 vascular CAFs ，高表达 GJA4, and RGS5 等 Subcluster 1 被作者定义为 matrix CAFs
90930发布于 2021-10-20
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