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Kolya and Tandem Repeat
Then Borya came and said that the new string contained a tandem repeat of length l as a substring. See notes for definition of a tandem repeat. Input The first line contains s (1 ≤ |s| ≤ 200). Output Print a single number — the maximum length of the tandem repeat that could have occurred in Output 6 Input aaabbbb 2 Output 6 Input abracadabra 10 Output 20 Note A tandem
38120编辑于 2022-07-10 - 来自专栏生信修炼手册
Tandem Repeats Finder:串联重复序列查找工具
Tandem Repeats Finder, 简称TRF, 是一款串联重复序列查找工具，repeatmasker 程序中就整合了这个软件，官网如下 https://tandem.bu.edu/trf/trf.html 除了在线服务，也可以下载软件本地运行，下载链接如下 https://tandem.bu.edu/trf/trf.download.html ?
4.1K31发布于 2020-05-08 - 来自专栏点云PCL
TANDEM 基于深度多视图立体视觉的实时跟踪和稠密建图
在相机跟踪方面优于其他先进的传统和基于学习的单目视觉里程计(VO)方法， 此外，TANDEM还展示了最先进的实时三维重建性能。 主页：https://go.vision.in.tum.de/tandem 图1:TANDEM是一种单目密集SLAM方法，用于估计相机姿势并实时重建3D环境 主要贡献 （1）提出一种新颖的实时单目密集 深度比较，TANDEM产生更精细的比例细节，例如第二排的设备或第三排的梯子，对于EuRoC，只有稀疏的地面真实深度可用。 图4:Atlas和TANDEM在未知序列上的定性比较，Atlas不构建纹理网格，这里还从TANDEM渲染纯几何体以进行比较 表1:EuRoC的位姿评估，所有的方法都是模拟对齐的w.r.t.真值轨迹，显示了五次运行期间的平均绝对姿态误差和标准偏差 我们认为，TANDEM三维重建的效果进一步缩小了RGB-D重建之间的差距。
1.1K20编辑于 2022-01-27 - 来自专栏疯狂学习GIS
12米、30米TanDEM-X DEM数据申请方式（很麻烦）
本文介绍全球12米与30米高空间分辨率的数字高程模型（DEM）数据——TanDEM-X数据的下载申请方法。 Tandem-X卫星项目于2010年6月启动，并于2010年6月21日和2010年12月21日分别发射两颗卫星，即TerraSAR-X和TanDEM-X。 Tandem-X卫星之间以极低的距离进行飞行，形成了一对相互独立但高度协同的雷达卫星。Tandem-X卫星项目的主要任务是通过合成孔径雷达技术获取地球表面的高分辨率三维地形和地貌数据。 因此，如果大家是个人身份，或者需要的数据比较多，并不建议用12米与30米的TanDEM-X数据，不如用其他可以公开下载的数据。 首先，我们进入12米与30米TanDEM-X数据的申请网站（https://tandemx-science.dlr.de/cgi-bin/wcm.pl?
70130编辑于 2023-09-06 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
跟着Bioinformatics学数据分析:StainedGlass可视化展示基因组水平上的tandem repeat
论文 StainedGlass: interactive visualization of massive tandem repeat structures with identity heatmaps https://mrvollger.github.io/StainedGlass/ https://github.com/mrvollger/StainedGlass 这个工具是用来可视化展示基因组水平上tandem
89230编辑于 2023-08-23 - 来自专栏hrscy
Swift2.1-继承继承
下个例子创建了一个Bicycle类的子类，一个两座的自行车称为"tandem": class Tandem: Bicycle { var currentNumberOfPassengers = 0 } Tandem从Bicycle继承了所有的属性和方法，也依次从Vehicle继承了所有属性和方法。 Tandem子类也添加了一个新的称为currentNumberOfPassengers的存储属性，并且有一个默认值0: let tandem = Tandem() tandem.hasBasket = true tandem.currentNumberOfPassengers = 2 tandem.currentSpeed = 22.0 print("Tandem: \(tandem.description )") // Tandem: traveling at 22.0 miles per hour 重写 一个子类可以提供它自己的实例方法，类型方法，实例属性，类型属性或下标脚本的自定义实现，否则，它将会从父类继承
61510发布于 2018-08-30 - 来自专栏pandacode_cn
Swift基础 继承
下一个示例为被称为“串联”的双座自行车创建Bicycle子类： class Tandem: Bicycle { var currentNumberOfPassengers = 0 } Tandem The Tandem subclass also adds a new stored property called currentNumberOfPassengers, with a default 如果您创建Tandem实例，您可以处理其任何新的和继承的属性，并查询它从Vehicle继承的只读description属性： let tandem = Tandem() tandem.hasBasket = true tandem.currentNumberOfPassengers = 2 tandem.currentSpeed = 22.0 print(“Tandem: (tandem.description )”) // Tandem: traveling at 22.0 miles per hour 压倒一切的 子类可以提供实例方法、类型方法、实例属性、类型属性或下标的自定义实现，否则它将从超类继承。
65600编辑于 2023-07-17 - 来自专栏3D视觉从入门到精通
密集单目 SLAM 的概率体积融合
从图4中，我们可以看到Tandem比我们的更完整（见我们重建中右下角缺失的地板条），同时稍微不太准确（见重建的左上角部分，在Tandem的网格中扭曲）。 从表中可以看出，我们提出的方法在准确性方面表现最好，差距很大（与 Tandem 相比高达 90%，与 V1 03 的基线相比高达 92%），而 Tandem 达到了第二 -整体最佳准确度。 图 6 显示了 Tandem（顶部）和我们的重建（底部）的估计云（V2 01）根据到地面真实云中最近点的距离（准确性）进行颜色编码。我们可以从这个图中看到我们的重建比 Tandem 的更准确。 图 5 显示了 Tandem 和我们的方法重建的 3D 网格的特写视图。 仔细观察 Tandem 的 3D 重建与我们的之间的差异。 EuRoC V2 01 数据集 图 6. Tandem（上）和我们（下）的 3D 网格重建结果的精度评估。
1.6K30编辑于 2023-04-29 - 来自专栏Y大宽
1️⃣ 序列获取（1）：DNA序列获取
pseudogene 3 STRBase 短串联重复序列数据库:short tandem repeat DNA internet database 已经无法打开 具体请参考文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov /pmc/articles/PMC29767/ 4 TRDB 串联重复数据库:tandem repeats databse 原作https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles
1.5K10发布于 2019-01-28 - 来自专栏生信喵实验柴
MCScanX共线性分析
mv all.blast all.gff all ~/biosoft/MCScanX/MCScanX all/all *.collinearity: 成对的共线性区域 *.tandem #1 Detect_syntenic_tandem_arrays detect_collinear_tandem_arrays -g os_sb.gff -b os_sb.blast -c os_sb.collinearity
1.8K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏三代测序-说
全基因组 - 人类基因组变异分析(PacBio) -- minimap2 + Sniffles2
$ sniffles --input sample1.bam --vcf sample1.vcf.gz --tandem-repeats tandem_repeats.bed --reference genome.fa 单样本分别检测变异$ sniffles -t 12 --input HG002_1.minimap2.align.bam --vcf HG002_1.vcf.gz --snf HG002_1.snf --tandem-repeats no_alt_analysis_set.trf.bed$ sniffles -t 12 --input HG003.minimap2.align.bam --vcf HG003.vcf.gz --snf HG003.snf --tandem-repeats no_alt_analysis_set.trf.bed$ sniffles -t 12 --input HG004.minimap2.align.bam --vcf HG004.vcf.gz --snf HG004.snf --tandem-repeats
2.7K10编辑于 2023-11-26 - 来自专栏生信宝典
RepeatMasker安装和使用
TRF(Tandem Repeat Finder)搜寻串联重复序列 http://tandem.bu.edu/trf/trf.download.html 4.09 2016-2-22 最新版4.09，本操作系统需要安装其中的 legacy的64位版才能运行 cd ~/bin/ wget http://tandem.bu.edu/trf/downloads/trf409.legacylinux64 chmod +x trf409 2.2.28/bin/rmblastn 2. trf运行报错 是由于Linux legacy GLIBC的版本兼容性问题，故作者提供了两个版本，原文中的如果不可用，试试下面另一个版本 wget http://tandem.bu.edu
4K111发布于 2018-02-05 - 来自专栏人称T客
创业公司不要盲目追求增长 太快容易扯着蛋
来源: Tandem Capital 这些公司公布了每月的收入增长速度，从6%到200%的范围不等，均值为60%，中间值为41%。其中，有6家公司还宣称，每月收入至少翻了一番。 来源: Tandem Capital 如果将这22家公司的月增长速度跟公布的收入数字进行统计计算，那么就能得出这些公司一年后每月收入总和会达到210万美金，即平均每家公司每月收入为9.63亿美金。 来源: Tandem Capital 如果在YC的催化作用下，保持以上增速的创业公司很有可能会成长为像Airbnb这样的独角兽，但整体来看，结果往往并非如此。
65680发布于 2018-03-26 - 来自专栏Y大宽
TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析2
基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析 文件准备（物种比对到自身的.blast文件，物种基因信息文件.gff文件），运行MCScanX，输出collinear和tandem文件 基因家族成员的来源分析 image.png 可视化 先得到串联重复序列的link文件 上面得到的.tandem文件用excel打开并进行分列，另存为txt文件 ? image.png 结果 ?
25.8K36发布于 2018-10-08 - 来自专栏DrugOne
Nat. Comput. Sci. | 用于兆级质谱数据库搜索的高性能计算框架
Tandem v.17.2.1, X!!Tandem v.10.12.1 和SW-Tandem。该论文设计了6个搜索实验，按照实验工作负载大小的升序排列为a-f。
62940发布于 2021-09-17 - 来自专栏三代测序-说
全基因组 - 人类基因组变异分析（PacBio) （5）-- pbsv
ref.sample1.svsig.gz tabix -c '#' -s 3 -b 4 -e 4 ref.sample2.svsig.gz It is highly recommended to provide one tandem repeat annotation .bed file of your reference to pbsv discover via --tandem-repeats. 实际运行： #HG002_1 $ nohup pbsv discover --tandem-repeats Human_ref/human_GRCh38_no_alt_analysis_set.trf.bed HG002_1.align.bam HG002_1.svsig.gz & #HG003 $ nohup pbsv discover --tandem-repeats Human_ref/human_GRCh38 _no_alt_analysis_set.trf.bed HG003.align.bam HG003.svsig.gz & #HG004 $ nohup pbsv discover --tandem-repeats
2.1K00编辑于 2023-11-24 - 来自专栏小明的数据分析笔记本
跟着PNAS学数据分析：MUM&Co软件基于基因组做结构变异检测
github主页 https://github.com/SAMtoBAM/MUMandCo 工具是一个shell脚本，需要安装MUMmer4 能够检测的变异类型有 Deletions, insertions, tandem duplications and tandem contractions (>=50bp & <=150kb) Inversions (>=1kb) , translocations (>=10kb)
90330编辑于 2023-10-20 - 来自专栏生信菜鸟团
使用 Manta 检测结构变异--肿瘤基因组测序数据分析专栏
SVLEN=76;CIGAR=1M76I1D GT:FT:GQ:PL:PR:SR 0/1:PASS:249:480,0,246:0,0:17,13 chr1 789487 MantaDUP:TANDEM :10:601:606:0:0:0 G <DUP:TANDEM> 18 MinQUAL END=224014523;SVTYPE=DUP;SVLEN=223225036;IMPRECISE ;CIPOS=-98,98;CIEND=-147,148 GT:FT:GQ:PL:PR 0/1:PASS:18:68,0,461:31,9 chr1 1068747 MantaDUP:TANDEM :36:1:2:0:0:0 C <DUP:TANDEM> 651 PASS END=1068825;SVTYPE=DUP;SVLEN=78;CIPOS=0,9;CIEND=0,9;
6.1K20编辑于 2022-05-24 - 来自专栏VoiceVista语音智能
CEVA - ClearVox
of Arrival, BF,降噪和回声消除 ClearVox Universal - 适用于智能家居，穿戴和车载 ClearVox Headset - 为耳机应用优化 与WhisPro联手合作(in tandem
75120发布于 2020-03-04 - 来自专栏生信修炼手册
Dfam:真核生物转座元件数据库
Low_Complexity代表低复杂度序列，指的是富含某些碱基，比如富含AT的序列；Tandem_Repeat代表串联重复序列，motif长度为2-10bp的串联重复序列称为Simple_Repeat
2.7K11发布于 2020-05-08
腾讯云开发者
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